Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl10_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3in11ex11                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl10_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 11:57:09 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 2                                                    
28 - 3 Copies: 5                                                    
29 - 4 Copies: 4                                                    
30 - 5 Copies: 2                                                    
31 - 8 Copies: 1                                                    
32 > 10 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-239 8 28.9072 29.3515 -0.4443     PSMD3in11ex11 RNase P 10 4.09 4     2 2 28.8714 29.5268 -0.6554 0.30 -1.03 2.05 3.53 4.73 1.20
40 10-239 20 28.8357 29.7021 -0.8665         10                                
41 10-240 32 27.6573 28.2168 -0.5595     PSMD3in11ex11 RNase P 10 3.61 4     2 2 27.6709 28.1459 -0.4750 0.12 -0.85 1.80 3.40 3.83 0.42
42 10-240 44 27.6846 28.0750 -0.3904         10                                
43 10-241 56 28.9849 29.1630 -0.1781     PSMD3in11ex11 RNase P 10 3.24 3     2 2 29.0157 29.3346 -0.3189 0.20 -0.70 1.62 2.94 3.57 0.63
44 10-241 68 29.0465 29.5062 -0.4597         10                                
45 10-245 80 28.0000 28.2024 -0.2024     PSMD3in11ex11 RNase P 10 2.59 3     2 2 28.4639 28.4583 0.0055 0.29 -0.37 1.29 2.24 2.99 0.75
46 10-245 92 28.9278 28.7142 0.2135         10                                
47 10-246 104 28.8849 29.2009 -0.3161     PSMD3in11ex11 RNase P 10 3.86 4     2 2 28.2801 28.8527 -0.5726 0.36 -0.95 1.93 3.23 4.61 1.38
48 10-246 116 27.6754 28.5045 -0.8292         10                                
49 10-249 128 26.9980 27.0499 -0.0519     PSMD3in11ex11 RNase P 10 3.30 3     2 2 26.7286 27.0726 -0.3440 0.41 -0.72 1.65 2.69 4.04 1.34
50 10-249 140 26.4592 27.0953 -0.6361         10                                
51 10-251 152 25.9499 29.2072 -3.2573     PSMD3in11ex11 RNase P 10 25.61 26     2 2 25.7996 29.1013 -3.3017 0.06 -3.68 12.80 24.83 26.41 1.58
52 10-251 164 25.6493 28.9953 -3.3461         10                                
53 10-252 176 26.0084 26.8277 -0.8193     PSMD3in11ex11 RNase P 10 4.65 5     2 2 25.9650 26.8057 -0.8407 0.03 -1.22 2.33 4.58 4.72 0.14
54 10-252 188 25.9215 26.7837 -0.8621         10                                
55 10-254 200 24.7519 26.7386 -1.9868     PSMD3in11ex11 RNase P 10 7.52 8     2 2 25.1661 26.7007 -1.5345 0.64 -1.91 3.76 5.50 10.29 4.79
56 10-254 212 25.5804 26.6627 -1.0823         10                                
57 10-255 224 27.1603 28.0799 -0.9195     PSMD3in11ex11 RNase P 10 4.41 4     2 2 27.1711 27.9345 -0.7634 0.22 -1.14 2.20 3.96 4.91 0.96
58 10-255 236 27.1818 27.7891 -0.6073         10                                
59 10-256 248 27.3411 28.1881 -0.8470     PSMD3in11ex11 RNase P 10 5.35 5     2 2 27.4224 28.4651 -1.0428 0.28 -1.42 2.67 4.67 6.13 1.46
60 10-256 260 27.5036 28.7422 -1.2385         10                                
61 10-257 272 27.7920 27.7257 0.0662     PSMD3in11ex11 RNase P 10 2.79 3     2 2 27.1555 27.2571 -0.1016 0.24 -0.48 1.39 2.48 3.13 0.65
62 10-257 284 26.5190 26.7885 -0.2695         10                                
63 10-258 296 26.7201 26.5051 0.2150     PSMD3in11ex11 RNase P 10 1.60 2     2 2 27.3070 26.6119 0.6951 0.68 0.32 0.80 1.15 2.24 1.09
64 10-258 308 27.8940 26.7187 1.1753         10                                
65 10-259 320 28.4793 28.7000 -0.2207     PSMD3in11ex11 RNase P 10 3.32 3     2 2 28.4331 28.7888 -0.3557 0.19 -0.73 1.66 3.03 3.65 0.62
66 10-259 332 28.3869 28.8776 -0.4907         10                                
67 DNActrl 368 25.1352 24.6678 0.4674     PSMD3in11ex11 RNase P 10 2.00 2     2 2 24.9513 24.5746 0.3767 0.13 0.00 1.00 1.88 2.13 0.25
68 DNActrl 380 24.7674 24.4814 0.2860         10                                
69 NTC 344 39.9357 undetermined undetermined x NTC PSMD3in11ex11 RNase P 10         2                    
70 NTC 356 35.7490 undetermined undetermined x NTC     10