Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl26_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3in11ex11                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl26_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 2:09:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 4                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 1                                                    
28 - 5 Copies: 1                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.3180                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-716 8 30.5387 28.0548 2.4839     PSMD3in11ex11 RNase P 26 0.58 1 0.99 1.10 2 2 31.2049 28.6036 2.6013 0.17 1.78 0.29 0.54 0.63 0.09
39 10-716 20 31.8711 29.1524 2.7187         26                                
40 10-717 32 29.8721 28.2393 1.6328     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.12 1 < 0.50 0.21 2 2 29.7189 28.0665 1.6524 0.03 0.83 0.56 1.11 1.14 0.03
41 10-717 44 29.5658 27.8937 1.6721         26                                
42 10-722T 56 29.0773 28.5169 0.5604     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.65 2 0.65 0.07 2 2 29.6024 28.5010 1.1013 0.76 0.28 0.82 1.13 2.40 1.27
43 10-722T 68 30.1274 28.4852 1.6423         26                                
44 10-726 80 33.2058 32.1540 1.0518     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.79 2 0.83 0.04 2 2 33.0603 32.0756 0.9847 0.09 0.16 0.89 1.71 1.87 0.17
45 10-726 92 32.9148 31.9971 0.9177         26                                
46 10-730 104 29.4463 28.8152 0.6312     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.92 2 0.80 0.04 2 2 29.6527 28.7700 0.8827 0.36 0.06 0.96 1.61 2.28 0.67
47 10-730 116 29.8591 28.7248 1.1343         26                                
48 10-731 128 29.1052 28.1237 0.9815     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.75 2 0.84 0.04 2 2 29.4063 28.3945 1.0119 0.04 0.19 0.88 1.72 1.79 0.07
49 10-731 140 29.7075 28.6652 1.0423         26                                
50 10-732 152 28.9602 28.1669 0.7933     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.66 2 0.77 0.07 2 2 29.1531 28.0640 1.0891 0.42 0.27 0.83 1.35 2.04 0.69
51 10-732 164 29.3459 27.9611 1.3848         26                                
52 10-733 176 28.4962 27.1045 1.3918     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.31 1 < 0.50 0.92 2 2 28.6546 27.2222 1.4324 0.06 0.61 0.66 1.27 1.35 0.07
53 10-733 188 28.8129 27.3399 1.4730         26                                
54 10-734 200 33.8588 32.8113 1.0474     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.71 2 0.66 0.09 2 1 33.8588 32.8113 1.0474 0.00 0.23 0.86 1.71 1.71 0.00
55 10-734 212 33.5708 33.1648 0.4060 x VICET     26                                
56 10-735 224 31.1245 30.4501 0.6744     PSMD3in11ex11 RNase P 26 2.25 2 0.71 0.22 2 2 31.6287 30.9754 0.6533 0.03 -0.17 1.12 2.22 2.28 0.07
57 10-735 236 32.1329 31.5007 0.6322         26                                
58 10-738 248 29.3670 29.4439 -0.0769     PSMD3in11ex11 RNase P 26 3.44 3 < 0.50 0.26 2 2 29.6695 29.6316 0.0379 0.16 -0.78 1.72 3.18 3.73 0.55
59 10-738 260 29.9720 29.8193 0.1527         26                                
60 10-739 272 31.1843 30.0186 1.1658     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.43 1 < 0.50 1.17 2 2 30.6199 29.3124 1.3075 0.20 0.49 0.71 1.29 1.58 0.28
61 10-739 284 30.0555 28.6062 1.4493         26                                
62 10-747 296 29.0085 29.7053 -0.6968     PSMD3in11ex11 RNase P 26 4.91 5 < 0.50 0.05 2 2 29.4093 29.8815 -0.4722 0.32 -1.29 2.45 4.20 5.73 1.53
63 10-747 308 29.8101 30.0578 -0.2477         26                                
64 10-748 320 29.5224 28.6187 0.9037     PSMD3in11ex11 RNase P 26 1.81 2 0.81 0.04 2 2 29.7315 28.7624 0.9691 0.09 0.15 0.90 1.73 1.89 0.16
65 10-748 332 29.9407 28.9062 1.0345         26                                
66 DNActrl 368 24.6729 23.7243 0.9487     PSMD3in11ex11 RNase P 26 2.00 2 0.78 0.09 2 2 24.5510 23.7289 0.8221 0.18 0.00 1.00 1.83 2.18 0.35
67 DNActrl 380 24.4291 23.7336 0.6955         26                                
68 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3in11ex11 RNase P 26         2                    
69 NTC 356 undetermined undetermined undetermined x NTC     26