Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl27_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3in11ex11                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl27_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 4:02:30 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 1 Copy: 6                                                    
29 - 2 Copies: 6                                                    
30 - 3 Copies: 2                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-749 8 31.8602 30.7975 1.0627     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.71 2     2 2 31.7730 30.7789 0.9940 0.10 0.23 0.85 1.63 1.79 0.16
39 10-749 20 31.6858 30.7604 0.9254         27                                
40 10-750 32 30.9474 29.5658 1.3816     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.11 1     2 2 31.2220 29.6115 1.6105 0.32 0.85 0.56 0.95 1.30 0.35
41 10-750 44 31.4966 29.6572 1.8394         27                                
42 10-754 56 33.7183 31.8176 1.9007     PSMD3in11ex11 RNase P 27 0.86 1     2 2 34.2626 32.2817 1.9809 0.11 1.22 0.43 0.81 0.91 0.10
43 10-754 68 34.8068 32.7457 2.0611         27                                
44 10-756 80 29.2095 28.1904 1.0191     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.54 2     2 2 29.2911 28.1462 1.1449 0.18 0.38 0.77 1.41 1.68 0.27
45 10-756 92 29.3727 28.1019 1.2708         27                                
46 10-760 104 31.4537 29.7856 1.6682     PSMD3in11ex11 RNase P 27 0.94 1     2 2 31.9295 30.0816 1.8479 0.25 1.08 0.47 0.83 1.07 0.24
47 10-760 116 32.4053 30.3776 2.0277         27                                
48 10-765 128 30.7565 30.7759 -0.0194     PSMD3in11ex11 RNase P 27 3.45 3     2 2 30.3360 30.3597 -0.0237 0.01 -0.79 1.73 3.44 3.46 0.02
49 10-765 140 29.9154 29.9435 -0.0280         27                                
50 10-766 152 32.9584 31.2333 1.7250     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.06 1     2 2 33.1929 31.5163 1.6766 0.07 0.91 0.53 1.03 1.10 0.07
51 10-766 164 33.4275 31.7993 1.6281         27                                
52 10-768 176 33.4014 31.0291 2.3723     PSMD3in11ex11 RNase P 27 0.72 1     2 2 33.3405 31.1085 2.2319 0.20 1.47 0.36 0.66 0.80 0.14
53 10-768 188 33.2795 31.1880 2.0915         27                                
54 10-769 200 33.3292 31.8862 1.4431     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.04 1     2 2 33.2788 31.5720 1.7068 0.37 0.94 0.52 0.87 1.25 0.38
55 10-769 212 33.2284 31.2578 1.9706         27                                
56 10-771 224 36.2223 33.5835 2.6388 x VICET PSMD3in11ex11 RNase P 27         2                    
57 10-771 236 35.5128 34.6364 0.8763 x VICET     27                                
58 10-773 248 28.6157 28.1363 0.4794     PSMD3in11ex11 RNase P 27 2.41 2     2 2 28.4403 27.9428 0.4975 0.03 -0.27 1.20 2.38 2.44 0.06
59 10-773 260 28.2649 27.7492 0.5156         27                                
60 10-775 272 28.8330 28.7873 0.0458     PSMD3in11ex11 RNase P 27 2.94 3     2 2 29.0527 28.8455 0.2072 0.23 -0.56 1.47 2.63 3.29 0.66
61 10-775 284 29.2723 28.9037 0.3686         27                                
62 10-779 296 29.4929 28.8416 0.6513     PSMD3in11ex11 RNase P 27 2.36 2     2 2 29.2432 28.7185 0.5248 0.18 -0.24 1.18 2.16 2.58 0.41
63 10-779 308 28.9936 28.5954 0.3982         27                                
64 10-781 320 29.7471 28.6366 1.1105     PSMD3in11ex11 RNase P 27 1.51 2     2 2 29.7045 28.5379 1.1666 0.08 0.40 0.76 1.46 1.57 0.12
65 10-781 332 29.6619 28.4392 1.2227         27                                
66 DNActrl 368 24.1823 23.4419 0.7404     PSMD3in11ex11 RNase P 27 2.00 2     2 2 24.1679 23.4040 0.7639 0.03 0.00 1.00 1.97 2.03 0.07
67 DNActrl 380 24.1535 23.3662 0.7874         27                                
68 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3in11ex11 RNase P 27         2                    
69 NTC 356 undetermined undetermined undetermined x NTC     27