Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120831_1000_2ndset_pl3_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3in11ex11                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120831_1000_2ndset_pl3_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 8/31/12 3:58:27 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 14                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 0 Copy: 1                                                    
28 - 1 Copy: 6                                                    
29 - 2 Copies: 3                                                    
30 - 3 Copies: 1                                                    
31 - 4 Copies: 1                                                    
32 - 10 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-046 8 26.8801 25.7951 1.0850     PSMD3in11ex11 RNase P 3 1.24 1     2 2 27.7712 26.0882 1.6830 0.85 0.69 0.62 0.82 1.87 1.06
40 10-046 20 28.6623 26.3812 2.2810         3                                
41 10-049 32 28.5304 26.7857 1.7447     PSMD3in11ex11 RNase P 3 0.74 1     2 2 29.6518 27.2335 2.4183 0.95 1.43 0.37 0.47 1.19 0.72
42 10-049 44 30.7732 27.6813 3.0919         3                                
43 10-052 56 29.3879 27.2815 2.1064     PSMD3in11ex11 RNase P 3 0.75 1     2 2 29.9314 27.5310 2.4005 0.42 1.41 0.38 0.61 0.92 0.31
44 10-052 68 30.4750 27.7804 2.6945         3                                
45 10-054 80 29.0979 29.5315 -0.4336     PSMD3in11ex11 RNase P 3 3.48 3     2 2 29.7089 29.5198 0.1892 0.88 -0.80 1.74 2.26 5.37 3.10
46 10-054 92 30.3200 29.5081 0.8120         3                                
47 10-055 104 29.7783 27.7085 2.0698     PSMD3in11ex11 RNase P 3 1.15 1     2 2 29.5261 27.7377 1.7884 0.40 0.80 0.58 0.95 1.40 0.45
48 10-055 116 29.2739 27.7669 1.5070         3                                
49 10-059 128 32.5726 29.2805 3.2922     PSMD3in11ex11 RNase P 3 0.42 0     2 2 32.7075 29.4818 3.2257 0.09 2.24 0.21 0.41 0.44 0.04
50 10-059 140 32.8423 29.6831 3.1592         3                                
51 10-062b 152 25.8750 27.3364 -1.4614     PSMD3in11ex11 RNase P 3 9.59 10     2 2 25.9276 27.1987 -1.2711 0.27 -2.26 4.79 8.40 10.94 2.54
52 10-062b 164 25.9801 27.0609 -1.0808         3                                
53 10-063 176 29.4756 26.9507 2.5249     PSMD3in11ex11 RNase P 3 0.58 1     2 2 29.8319 27.0500 2.7819 0.36 1.79 0.29 0.48 0.69 0.21
54 10-063 188 30.1882 27.1494 3.0389         3                                
55 10-065 200 29.1718 28.3890 0.7828     PSMD3in11ex11 RNase P 3 2.01 2     2 2 29.6340 28.6539 0.9801 0.28 -0.01 1.01 1.76 2.31 0.55
56 10-065 212 30.0962 28.9188 1.1774         3                                
57 10-066 224 26.9033 26.6498 0.2535     PSMD3in11ex11 RNase P 3 3.88 4     2 2 26.5532 26.5181 0.0351 0.31 -0.96 1.94 3.33 4.51 1.18
58 10-066 236 26.2032 26.3865 -0.1833         3                                
59 10-067 248 27.3243 26.7875 0.5369     PSMD3in11ex11 RNase P 3 2.31 2     2 2 27.7103 26.9291 0.7811 0.35 -0.21 1.16 1.95 2.74 0.79
60 10-067 260 28.0963 27.0708 1.0254         3                                
61 10-069b 272 27.0335 24.8856 2.1479     PSMD3in11ex11 RNase P 3 0.84 1     2 2 27.1454 24.8986 2.2468 0.14 1.26 0.42 0.78 0.90 0.11
62 10-069b 284 27.2573 24.9116 2.3456         3                                
63 DNActrl 320 25.3210 24.1157 1.2052     PSMD3in11ex11 RNase P 3 2.00 2     6 6 25.0565 24.0663 0.9902 0.35 0.00 1.00 1.54 2.59 1.05
64 DNActrl 332 24.4478 23.8333 0.6145         3                                
65 DNActrl 344 25.9950 24.6296 1.3654         3                                
66 DNActrl 356 25.6830 24.3379 1.3452         3                                
67 DNActrl 368 24.3689 23.6664 0.7026         3                                
68 DNActrl 380 24.5234 23.8152 0.7082         3                                
69 NTC 296 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3in11ex11 RNase P 3         2                    
70 NTC 308 undetermined undetermined undetermined x NTC     3