Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/PSMD3_exin11/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: PSMD3in11ex11                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 12:01:44 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 0 Copy: 1                                                    
26 - 1 Copy: 8                                                    
27 - 2 Copies: 2                                                    
28 - 3 Copies: 2                                                    
29 - 4 Copies: 1                                                    
30 > 10 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.3290                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-156 8 27.6189 26.0823 1.5366     PSMD3in11ex11 RNase P 7 1.21 1 0.54 0.47 2 2 27.3593 25.9191 1.4402 0.14 0.72 0.61 1.14 1.30 0.16
40 10-156 20 27.0997 25.7558 1.3439         7                                
41 10-157 32 25.8493 27.9657 -2.1164     PSMD3in11ex11 RNase P 7 15.33 15 < 0.50 0.08 2 2 25.8968 28.1152 -2.2184 0.14 -2.94 7.66 14.28 16.45 2.17
42 10-157 44 25.9443 28.2647 -2.3204         7                                
43 10-159 56 27.7024 26.2693 1.4331     PSMD3in11ex11 RNase P 7 1.44 1 < 0.50 1.04 2 2 27.8926 26.6945 1.1981 0.33 0.48 0.72 1.22 1.69 0.47
44 10-159 68 28.0828 27.1198 0.9630         7                                
45 10-161 80 27.3173 27.2938 0.0234     PSMD3in11ex11 RNase P 7 3.06 3 < 0.50 0.04 2 2 27.5146 27.4081 0.1065 0.12 -0.61 1.53 2.89 3.24 0.35
46 10-161 92 27.7120 27.5224 0.1896         7                                
47 10-162 104 29.4032 27.9749 1.4283     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.86 1 0.92 0.05 2 2 30.3472 28.4101 1.9371 0.72 1.22 0.43 0.60 1.22 0.62
48 10-162 116 31.2913 28.8453 2.4460         7                                
49 10-165 128 29.2113 27.1021 2.1091     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.72 1 0.98 0.15 2 2 29.0908 26.8873 2.2036 0.13 1.48 0.36 0.67 0.76 0.09
50 10-165 140 28.9704 26.6724 2.2980         7                                
51 10-171 152 29.9491 27.0693 2.8798     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.46 0     2 2 29.9208 27.0784 2.8424 0.05 2.12 0.23 0.45 0.47 0.02
52 10-171 164 29.8925 27.0875 2.8051         7                                
53 10-172 176 28.0738 26.7723 1.3015     PSMD3in11ex11 RNase P 7 1.57 2 < 0.50 0.14 2 2 27.9516 26.8841 1.0674 0.33 0.35 0.79 1.34 1.85 0.51
54 10-172 188 27.8294 26.9960 0.8334         7                                
55 10-175T 200 29.0210 26.9279 2.0931     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.72 1 0.97 0.10 2 2 29.2427 27.0524 2.1902 0.14 1.47 0.36 0.67 0.77 0.10
56 10-175T 212 29.4643 27.1770 2.2873         7                                
57 10-176 224 30.8010 28.2750 2.5260     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.68 1 0.98 0.19 2 2 30.6422 28.3737 2.2685 0.36 1.55 0.34 0.57 0.82 0.25
58 10-176 236 30.4835 28.4725 2.0110         7                                
59 10-181 248 27.9859 25.6207 2.3652     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.72 1 0.98 0.25 2 2 27.7166 25.5194 2.1972 0.24 1.48 0.36 0.64 0.81 0.17
60 10-181 260 27.4474 25.4181 2.0293         7                                
61 10-183 272 27.0522 26.5709 0.4813     PSMD3in11ex11 RNase P 7 2.67 3 < 0.50 0.04 2 2 27.1294 26.8239 0.3054 0.25 -0.41 1.33 2.36 3.01 0.65
62 10-183 284 27.2066 27.0770 0.1296         7                                
63 10-184 296 29.1500 27.0609 2.0891     PSMD3in11ex11 RNase P 7 0.85 1 0.93 0.04 2 2 28.9264 26.9788 1.9476 0.20 1.23 0.43 0.77 0.94 0.17
64 10-184 308 28.7028 26.8967 1.8060         7                                
65 10-185 320 27.8328 27.8764 -0.0437     PSMD3in11ex11 RNase P 7 4.43 4 < 0.50 0.14 2 2 27.4280 27.8553 -0.4273 0.54 -1.15 2.21 3.40 5.78 2.38
66 10-185 332 27.0232 27.8342 -0.8110         7                                
67 DNActrl 368 25.0129 24.2918 0.7211     PSMD3in11ex11 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.00 2 2 24.9160 24.1962 0.7198 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00
68 DNActrl 380 24.8191 24.1006 0.7185         7                                
69 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC PSMD3in11ex11 RNase P 7         2                    
70 NTC 356 undetermined undetermined undetermined x NTC     7