Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl12_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in10ex10                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl12_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 11:35:02 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 2 Copies: 5                                                    
26 - 3 Copies: 14                                                    
27 - 4 Copies: 3                                                    
28 - 5 Copies: 2                                                    
29 - 6 Copies: 3                                                    
30 - 7 Copies: 2                                                    
31 - 8 Copies: 1                                                    
32 - 9 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1313                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-679 2 27.6802 27.4749 0.2053     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.48 2 < 0.50 0.74 2 2 28.1521 28.0029 0.1492 0.08 -0.31 1.24 2.38 2.57 0.19
42 10-679 8 28.6240 28.5310 0.0930         12                                
43 10-680 26 28.3908 28.6652 -0.2744     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.22 3 0.61 0.16 2 2 28.3605 28.5890 -0.2285 0.06 -0.69 1.61 3.12 3.32 0.20
44 10-680 32 28.3302 28.5128 -0.1827         12                                
45 10-686 50 29.5365 29.4173 0.1192     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.05 3 0.59 0.09 2 2 29.5899 29.7411 -0.1512 0.38 -0.61 1.52 2.53 3.68 1.15
46 10-686 56 29.6433 30.0650 -0.4217         12                                
47 10-687 74 26.9299 27.2086 -0.2787     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.13 3 0.63 0.12 2 2 26.5889 26.7797 -0.1908 0.12 -0.65 1.57 2.95 3.33 0.38
48 10-687 80 26.2480 26.3508 -0.1028         12                                
49 10-689 98 27.6044 28.2629 -0.6585     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 4.23 4 < 0.50 0.10 2 2 27.5779 28.2023 -0.6244 0.05 -1.08 2.12 4.13 4.33 0.20
50 10-689 104 27.5513 28.1416 -0.5903         12                                
51 10-691 122 28.4099 28.4580 -0.0482     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.12 3 0.71 0.08 2 2 28.2922 28.4753 -0.1830 0.19 -0.64 1.56 2.84 3.42 0.58
52 10-691 128 28.1746 28.4925 -0.3179         12                                
53 10-694 146 31.7820 32.5433 -0.7613     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 5.94 6 < 0.50 0.15 2 2 31.2421 32.3550 -1.1130 0.50 -1.57 2.97 4.65 7.58 2.92
54 10-694 152 30.7021 32.1667 -1.4646         12                                
55 10-695 170 28.6265 30.1705 -1.5440     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 6.79 7 < 0.50 0.18 2 2 28.9245 30.2316 -1.3070 0.34 -1.76 3.40 5.77 8.01 2.24
56 10-695 176 29.2225 30.2926 -1.0701         12                                
57 10-696 194 30.3064 31.9552 -1.6488     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 5.65 6 < 0.50 0.27 2 2 30.6988 31.7389 -1.0401 0.86 -1.50 2.82 3.70 8.61 4.91
58 10-696 200 31.0911 31.5225 -0.4314         12                                
59 10-698 218 30.1968 30.3093 -0.1125     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.13 3 0.73 0.15 2 2 30.2608 30.4518 -0.1910 0.11 -0.65 1.57 2.97 3.31 0.34
60 10-698 224 30.3248 30.5944 -0.2696         12                                
61 10-700 242 29.8217 30.3352 -0.5135     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.90 4 < 0.50 0.09 2 2 29.8837 30.3882 -0.5045 0.01 -0.96 1.95 3.87 3.92 0.05
62 10-700 248 29.9457 30.4411 -0.4954         12                                
63 10-702 266 30.5793 29.4384 1.1409     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 1.56 2 0.78 0.39 2 2 30.0788 29.2634 0.8153 0.46 0.36 0.78 1.25 1.96 0.71
64 10-702 272 29.5782 29.0884 0.4897         12                                
65 10-706 290 27.6853 27.3737 0.3116     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.42 2 < 0.50 0.63 2 2 27.8417 27.6564 0.1853 0.18 -0.27 1.21 2.21 2.64 0.42
66 10-706 296 27.9981 27.9391 0.0590         12                                
67 10-707 314 31.2318 32.3517 -1.1199     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 5.28 5 < 0.50 0.13 2 2 31.0212 31.9652 -0.9440 0.25 -1.40 2.64 4.68 5.97 1.29
68 10-707 320 30.8107 31.5787 -0.7680         12                                
69 10-709 14 26.0930 26.1121 -0.0191     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.21 3 < 0.50 0.14 2 2 26.3557 26.5808 -0.2251 0.29 -0.68 1.60 2.78 3.70 0.92
70 10-709 20 26.6183 27.0495 -0.4312         12                                
71 10-710 38 28.8812 30.8754 -1.9941     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 9.20 9 < 0.50 0.18 2 2 28.7065 30.4508 -1.7443 0.35 -2.20 4.60 7.74 10.94 3.20
72 10-710 44 28.5318 30.0263 -1.4944         12                                
73 10-713 62 29.1857 29.9621 -0.7764     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 4.82 5 < 0.50 0.15 2 2 29.6112 30.4238 -0.8126 0.05 -1.27 2.41 4.70 4.95 0.24
74 10-713 68 30.0366 30.8855 -0.8489         12                                
75 10-715 86 26.2838 26.2851 -0.0013     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.78 3 0.54 0.19 2 2 26.2772 26.2924 -0.0152 0.02 -0.47 1.39 2.75 2.80 0.05
76 10-715 92 26.2706 26.2998 -0.0292         12                                
77 10-716 110 27.7755 28.2827 -0.5071     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.61 4 < 0.50 0.33 2 2 27.7203 28.1135 -0.3931 0.16 -0.85 1.80 3.33 3.90 0.57
78 10-716 116 27.6651 27.9443 -0.2792         12                                
79 10-717 134 27.8001 27.8538 -0.0537     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.78 3 0.64 0.17 2 2 27.8779 27.8968 -0.0190 0.05 -0.48 1.39 2.72 2.85 0.13
80 10-717 140 27.9557 27.9399 0.0158         12                                
81 10-722T 158 28.7461 28.7549 -0.0088     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.89 3 0.70 0.08 2 2 28.5691 28.6447 -0.0756 0.09 -0.53 1.45 2.76 3.03 0.27
82 10-722T 164 28.3922 28.5345 -0.1423         12                                
83 10-726 182 31.0260 32.3469 -1.3209     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 8.08 8 < 0.50 0.22 2 2 30.8243 32.3810 -1.5566 0.33 -2.01 4.04 6.86 9.51 2.65
84 10-726 188 30.6226 32.4150 -1.7924         12                                
85 10-730 206 27.5670 28.2177 -0.6507     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.30 3 < 0.50 0.13 2 2 28.0503 28.3156 -0.2653 0.55 -0.72 1.65 2.53 4.31 1.78
86 10-730 212 28.5336 28.4135 0.1201         12                                
87 10-731 230 28.0596 28.3481 -0.2886     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 3.41 3 0.52 0.23 2 2 27.9688 28.2822 -0.3133 0.03 -0.77 1.71 3.35 3.47 0.12
88 10-731 236 27.8781 28.2162 -0.3381         12                                
89 10-732 254 27.0375 27.0065 0.0310     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.93 3 0.70 0.10 2 2 27.3187 27.4143 -0.0957 0.18 -0.55 1.47 2.69 3.20 0.52
90 10-732 260 27.5998 27.8222 -0.2224         12                                
91 10-733 278 26.8320 26.8602 -0.0282     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.94 3 0.62 0.11 2 2 26.5231 26.6210 -0.0978 0.10 -0.56 1.47 2.80 3.08 0.28
92 10-733 284 26.2143 26.3817 -0.1675         12                                
93 10-734 302 30.6643 31.6460 -0.9818     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 6.47 6 < 0.50 0.20 2 2 30.6089 31.8447 -1.2358 0.36 -1.69 3.23 5.42 7.71 2.29
94 10-734 308 30.5535 32.0434 -1.4899         12                                
95 10-735 326 29.7809 31.3011 -1.5202     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 6.93 7 < 0.50 0.12 2 2 29.6398 30.9756 -1.3359 0.26 -1.79 3.47 6.10 7.88 1.78
96 10-735 332 29.4986 30.6502 -1.1516         12                                
97 10-738 350 29.3639 28.8941 0.4698     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 1.99 2 < 0.50 0.11 2 2 29.6353 29.1693 0.4660 0.01 0.01 0.99 1.98 1.99 0.01
98 10-738 356 29.9066 29.4445 0.4622         12                                
99 10-739 374 29.5231 29.4662 0.0569     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.64 3 < 0.50 0.27 2 2 29.4192 29.3629 0.0564 0.00 -0.40 1.32 2.64 2.64 0.00
100 10-739 380 29.3154 29.2595 0.0559         12                                
101 DNActrl 362 24.6611 23.9490 0.7121     SMARCE1in10ex10 RNase P 12 2.00 2 < 0.50 0.11 2 2 24.3371 23.8797 0.4574 0.36 0.00 1.00 1.68 2.39 0.71
102 DNActrl 368 24.0131 23.8104 0.2027         12                                
103 NTC 338 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in10ex10 RNase P 12         2                    
104 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC     12