Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120914_1000_3rdsetonly_pl16_last.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in10ex10                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120914_1000_3rdsetonly_pl16_last                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/14/12 2:56:43 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 12                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 1 Copy: 1                                                    
28 - 2 Copies: 2                                                    
29 - 3 Copies: 4                                                    
30 - 4 Copies: 1                                                    
31 - 5 Copies: 1                                                    
32 - 6 Copies: 2                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-877 26 32.2424 30.3845 1.8578     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 0.93 1     2 2 31.8534 30.2447 1.6087 0.35 1.11 0.46 0.78 1.10 0.32
40 10-877 32 31.4644 30.1049 1.3595         16                                
41 10-881 50 27.6892 27.9389 -0.2497     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 3.19 3     2 2 27.2625 27.4351 -0.1725 0.11 -0.68 1.60 3.03 3.37 0.34
42 10-881 56 26.8359 26.9312 -0.0954         16                                
43 10-882 74 31.8516 32.2346 -0.3830     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 5.28 5     2 2 31.3317 32.2285 -0.8968 0.73 -1.40 2.64 3.70 7.54 3.84
44 10-882 80 30.8118 32.2223 -1.4105         16                                
45 10-883 98 31.7591 32.5924 -0.8333     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 6.20 6     2 2 31.1744 32.3031 -1.1287 0.42 -1.63 3.10 5.05 7.61 2.56
46 10-883 104 30.5897 32.0138 -1.4241         16                                
47 10-884 122 31.2709 32.0154 -0.7445     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 5.76 6     2 2 30.7693 31.7930 -1.0237 0.39 -1.53 2.88 4.75 6.99 2.24
48 10-884 128 30.2677 31.5706 -1.3029         16                                
49 10-885 146 29.9044 29.8697 0.0347     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 3.30 3     2 2 29.2397 29.4586 -0.2189 0.36 -0.72 1.65 2.77 3.93 1.17
50 10-885 152 28.5751 29.0476 -0.4725         16                                
51 10-887 218 29.6610 30.3804 -0.7194     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 4.35 4     2 2 29.0996 29.7186 -0.6190 0.14 -1.12 2.18 4.06 4.67 0.61
52 10-887 224 28.5381 29.0567 -0.5186         16                                
53 10-888 242 28.5373 28.2785 0.2588     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 2.80 3     2 2 28.5137 28.4979 0.0158 0.34 -0.49 1.40 2.37 3.32 0.95
54 10-888 248 28.4900 28.7173 -0.2272         16                                
55 10-891 266 29.4815 28.8285 0.6530     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 1.73 2     2 2 28.9661 28.2522 0.7139 0.09 0.21 0.86 1.66 1.80 0.15
56 10-891 272 28.4507 27.6758 0.7749         16                                
57 341 290 31.5123 31.2075 0.3048     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 2.60 3     2 2 31.3337 31.2100 0.1237 0.26 -0.38 1.30 2.30 2.95 0.65
58 341 296 31.1551 31.2125 -0.0574         16                                
59 DNActrl 338 24.6332 24.0863 0.5469     SMARCE1in10ex10 RNase P 16 2.00 2     2 2 24.3122 23.8089 0.5033 0.06 0.00 1.00 1.94 2.06 0.12
60 DNActrl 344 23.9912 23.5316 0.4596         16                                
61 NTC 314 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in10ex10 RNase P 16         2                    
62 NTC 320 undetermined undetermined undetermined x NTC     16