Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120917_1000_3rdset_pl2_01_2nd.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in10ex10                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120917_1000_3rdset_pl2_01_2nd                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/17/12 4:43:49 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 30                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 1 Copy: 1                                                    
26 - 2 Copies: 9                                                    
27 - 3 Copies: 9                                                    
28 - 4 Copies: 6                                                    
29 - 5 Copies: 1                                                    
30 - 7 Copies: 1                                                    
31 - 8 Copies: 1                                                    
32 > 10 Copies: 1                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1433                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-055 2 27.0084 27.5315 -0.5230     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 4.26 4 < 0.50 0.15 2 2 26.7362 27.2312 -0.4950 0.04 -1.09 2.13 4.18 4.35 0.17
42 10-055 8 26.4640 26.9310 -0.4670         2                                
43 10-059 26 31.4321 29.9562 1.4759     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 1.38 1 < 0.50 0.81 2 2 30.6924 29.5554 1.1370 0.48 0.54 0.69 1.09 1.74 0.65
44 10-059 32 29.9527 29.1546 0.7981         2                                
45 10-062b 50 27.5469 26.9721 0.5749     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 1.87 2 0.95 0.27 2 2 27.5298 26.8336 0.6962 0.17 0.10 0.93 1.72 2.03 0.31
46 10-062b 56 27.5126 26.6950 0.8176         2                                
47 10-063 74 27.6771 27.0985 0.5787     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.22 2 0.71 0.05 2 2 27.3377 26.8887 0.4490 0.18 -0.15 1.11 2.03 2.42 0.40
48 10-063 80 26.9982 26.6788 0.3194         2                                
49 10-065 98 28.3267 28.4711 -0.1445     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.26 3 0.59 0.08 2 2 28.2464 28.3554 -0.1091 0.05 -0.71 1.63 3.18 3.34 0.16
50 10-065 104 28.1660 28.2397 -0.0737         2                                
51 10-066 122 26.6012 26.9133 -0.3122     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.78 4 < 0.50 0.51 2 2 25.9703 26.2935 -0.3232 0.02 -0.92 1.89 3.76 3.81 0.06
52 10-066 128 25.3395 25.6737 -0.3342         2                                
53 10-067 146 27.3383 27.0326 0.3056     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.07 3 < 0.50 0.13 2 2 26.6208 26.6409 -0.0201 0.46 -0.62 1.53 2.45 3.84 1.40
54 10-067 152 25.9034 26.2493 -0.3459         2                                
55 10-069b 170 25.4873 25.9770 -0.4897     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.50 3 < 0.50 0.09 2 2 25.0710 25.2802 -0.2093 0.40 -0.81 1.75 2.88 4.25 1.37
56 10-069b 176 24.6547 24.5835 0.0712         2                                
57 10-071 194 27.4683 27.1286 0.3397     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.49 2 < 0.50 0.25 2 2 27.0241 26.7430 0.2812 0.08 -0.32 1.24 2.39 2.59 0.20
58 10-071 200 26.5800 26.3574 0.2226         2                                
59 10-073 218 27.0301 27.2303 -0.2002     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.49 3 0.50 0.10 2 2 27.1583 27.3654 -0.2071 0.01 -0.80 1.75 3.47 3.51 0.03
60 10-073 224 27.2865 27.5004 -0.2139         2                                
61 10-078 242 29.1797 30.3761 -1.1964     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 7.69 8 < 0.50 0.21 2 2 28.5942 29.9398 -1.3456 0.21 -1.94 3.84 6.93 8.52 1.59
62 10-078 248 28.0087 29.5035 -1.4949         2                                
63 10-079b 266 27.5315 27.3148 0.2166     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.16 3 0.53 0.08 2 2 27.4046 27.4660 -0.0614 0.39 -0.66 1.58 2.60 3.83 1.22
64 10-079b 272 27.2778 27.6172 -0.3394         2                                
65 10-083 290 25.8684 25.8741 -0.0057     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.10 3 0.52 0.10 2 2 25.7614 25.7985 -0.0371 0.04 -0.63 1.55 3.04 3.17 0.14
66 10-083 296 25.6543 25.7228 -0.0685         2                                
67 10-085 314 29.2189 28.8266 0.3923     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.09 2 0.87 0.08 2 2 29.0112 28.4754 0.5359 0.20 -0.06 1.04 1.89 2.30 0.42
68 10-085 320 28.8035 28.1241 0.6794         2                                
69 10-086 14 27.1653 28.9084 -1.7431     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 10.73 11 < 0.50 0.26 2 2 26.9761 28.8029 -1.8268 0.12 -2.42 5.36 10.12 11.37 1.25
70 10-086 20 26.7868 28.6973 -1.9105         2                                
71 10-092 38 28.5918 28.7760 -0.1842     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.83 4 < 0.50 0.32 2 2 28.1680 28.5101 -0.3421 0.22 -0.94 1.92 3.44 4.28 0.84
72 10-092 44 27.7443 28.2442 -0.4999         2                                
73 10-094 62 26.6274 27.1626 -0.5353     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 4.16 4 < 0.50 0.08 2 2 26.4288 26.8870 -0.4582 0.11 -1.05 2.08 3.94 4.38 0.44
74 10-094 68 26.2303 26.6114 -0.3812         2                                
75 10-095 86 27.7597 28.0259 -0.2662     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.55 4 < 0.50 0.98 2 2 27.4618 27.6925 -0.2307 0.05 -0.83 1.77 3.46 3.64 0.17
76 10-095 92 27.1640 27.3592 -0.1952         2                                
77 10-096 110 26.8644 26.5948 0.2696     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.39 2 < 0.50 0.17 2 2 26.8408 26.4981 0.3427 0.10 -0.25 1.19 2.27 2.51 0.24
78 10-096 116 26.8172 26.4015 0.4157         2                                
79 10-097 134 27.9686 27.9124 0.0562     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.08 3 < 0.50 0.09 2 2 27.5850 27.6105 -0.0255 0.12 -0.62 1.54 2.91 3.26 0.35
80 10-097 140 27.2015 27.3086 -0.1071         2                                
81 10-098 158 30.5443 31.0925 -0.5482     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 5.15 5 < 0.50 0.18 2 2 30.2951 31.0618 -0.7667 0.31 -1.36 2.57 4.42 5.99 1.56
82 10-098 164 30.0459 31.0311 -0.9852         2                                
83 10-099 182 27.6943 28.3240 -0.6298     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 4.33 4 < 0.50 0.09 2 2 27.5275 28.0446 -0.5171 0.16 -1.11 2.16 4.00 4.68 0.68
84 10-099 188 27.3607 27.7652 -0.4045         2                                
85 10-102 206 28.5128 28.5591 -0.0463     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.26 3 0.54 0.04 2 2 28.3734 28.4836 -0.1102 0.09 -0.71 1.63 3.12 3.41 0.29
86 10-102 212 28.2341 28.4082 -0.1741         2                                
87 10-103 230 29.8800 29.5176 0.3624     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.38 2 < 0.50 0.20 2 2 29.9782 29.6335 0.3447 0.03 -0.25 1.19 2.35 2.41 0.06
88 10-103 236 30.0764 29.7494 0.3270         2                                
89 10-105 254 27.9491 28.1468 -0.1977     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 3.13 3 0.51 0.07 2 2 27.8371 27.8844 -0.0473 0.21 -0.64 1.56 2.82 3.47 0.65
90 10-105 260 27.7251 27.6220 0.1030         2                                
91 10-106 278 28.7325 30.1711 -1.4386     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 7.48 7 < 0.50 0.12 2 2 28.7585 30.0650 -1.3065 0.19 -1.90 3.74 6.83 8.20 1.37
92 10-106 284 28.7846 29.9590 -1.1744         2                                
93 10-107 302 26.3243 25.5353 0.7890     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.02 2 0.84 0.07 2 2 26.0351 25.4516 0.5835 0.29 -0.01 1.01 1.75 2.33 0.58
94 10-107 308 25.7460 25.3679 0.3781         2                                
95 10-109 326 26.8681 26.4810 0.3871     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.29 2 0.56 0.07 2 2 26.7314 26.3319 0.3996 0.02 -0.20 1.15 2.27 2.31 0.04
96 10-109 332 26.5948 26.1827 0.4120         2                                
97 DNActrl 362 24.7580 24.2844 0.4736     SMARCE1in10ex10 RNase P 2 2.00 2 0.86 0.09 2 2 24.6461 24.0494 0.5968 0.17 0.00 1.00 1.84 2.18 0.34
98 DNActrl 368 24.5342 23.8143 0.7199         2                                
99 NTC 338 39.7959 undetermined undetermined x NTC SMARCE1in10ex10 RNase P 2         2                    
100 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC     2