Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120918_1000_3rdset_pl4_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in10ex10                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120918_1000_3rdset_pl4_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/18/12 12:51:33 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 2                                                    
26 - 2 Copies: 8                                                    
27 - 3 Copies: 13                                                    
28 - 4 Copies: 5                                                    
29 - 5 Copies: 2                                                    
30 - 6 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 6                                                    
33 - Undetermined VIC Ct: 2                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1240                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-175T 2 27.9311 27.4145 0.5165     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.28 2 < 0.50 0.21 2 2 27.4729 27.0578 0.4151 0.14 -0.19 1.14 2.12 2.44 0.32
42 10-175T 8 27.0148 26.7011 0.3137         4                                
43 10-176 26 28.3858 28.5037 -0.1179     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.46 3 < 0.50 0.47 2 2 28.2038 28.3949 -0.1910 0.10 -0.79 1.73 3.29 3.64 0.35
44 10-176 32 28.0219 28.2860 -0.2641         4                                
45 10-181 50 26.3623 26.1795 0.1828     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.06 3 0.52 0.12 2 2 25.9817 25.9938 -0.0121 0.28 -0.61 1.53 2.67 3.50 0.83
46 10-181 56 25.6011 25.8082 -0.2071         4                                
47 10-183 74 26.2626 26.8667 -0.6042     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 6.25 6 < 0.50 0.21 2 2 25.5760 26.6181 -1.0422 0.62 -1.64 3.12 4.61 8.46 3.85
48 10-183 80 24.8894 26.3695 -1.4802         4                                
49 10-184 98 27.7027 27.0487 0.6540     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.46 2 < 0.50 0.33 2 2 27.6069 27.3055 0.3015 0.50 -0.30 1.23 1.93 3.14 1.22
50 10-184 104 27.5112 27.5623 -0.0511         4                                
51 10-185 122 28.4399 28.0686 0.3713     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.89 3 < 0.50 0.12 2 2 27.8393 27.7669 0.0725 0.42 -0.53 1.44 2.35 3.55 1.20
52 10-185 128 27.2388 27.4651 -0.2264         4                                
53 10-186 146 28.3097 28.1933 0.1164     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.11 3 0.62 0.07 2 2 28.2856 28.3202 -0.0345 0.21 -0.64 1.55 2.80 3.45 0.65
54 10-186 152 28.2616 28.4471 -0.1855         4                                
55 10-188 170 28.7991 28.5321 0.2670     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.93 3 < 0.50 0.10 2 2 28.4678 28.4188 0.0489 0.31 -0.55 1.47 2.52 3.41 0.89
56 10-188 176 28.1364 28.3056 -0.1692         4                                
57 10-189 194 27.3985 27.4590 -0.0606     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.06 3 0.56 0.08 2 2 26.9956 27.0076 -0.0120 0.07 -0.61 1.53 2.96 3.16 0.21
58 10-189 200 26.5927 26.5562 0.0365         4                                
59 10-190 218 28.7939 28.5120 0.2819     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.66 3 < 0.50 0.32 2 2 28.4323 28.2430 0.1892 0.13 -0.41 1.33 2.50 2.84 0.34
60 10-190 224 28.0707 27.9741 0.0966         4                                
61 10-197a 242 27.7111 27.1808 0.5303     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.11 2 < 0.50 0.15 2 2 27.4190 26.8934 0.5257 0.01 -0.08 1.05 2.10 2.11 0.01
62 10-197a 248 27.1270 26.6060 0.5211         4                                
63 10-198a 266 26.2518 26.6139 -0.3621     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 4.32 4 < 0.50 0.20 2 2 26.1406 26.6502 -0.5096 0.21 -1.11 2.16 3.90 4.78 0.89
64 10-198a 272 26.0294 26.6866 -0.6572         4                                
65 10-200 290 27.5957 26.8468 0.7489     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 1.90 2 0.56 0.11 2 2 27.2052 26.5330 0.6722 0.11 0.07 0.95 1.81 2.01 0.20
66 10-200 296 26.8147 26.2192 0.5954         4                                
67 10-201 314 26.3126 27.3592 -1.0466     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 5.23 5 < 0.50 0.19 2 2 26.2638 27.0488 -0.7850 0.37 -1.39 2.61 4.36 6.27 1.91
68 10-201 320 26.2151 26.7384 -0.5233         4                                
69 10-203 338 26.5186 26.3275 0.1911     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.41 2 < 0.50 0.40 2 2 26.6100 26.2808 0.3292 0.20 -0.27 1.21 2.19 2.66 0.46
70 10-203 344 26.7015 26.2340 0.4674         4                                
71 10-204 362 26.8539 27.1832 -0.3293     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.64 4 < 0.50 0.21 2 2 26.5219 26.7843 -0.2624 0.09 -0.86 1.82 3.47 3.81 0.34
72 10-204 368 26.1899 26.3853 -0.1955         4                                
73 10-206 14 25.6926 26.2627 -0.5702     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 4.24 4 < 0.50 0.16 2 2 25.3185 25.8015 -0.4831 0.12 -1.08 2.12 3.99 4.50 0.51
74 10-206 20 24.9444 25.3403 -0.3960         4                                
75 10-207 38 27.5466 27.4388 0.1079     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.72 3 < 0.50 0.22 2 2 27.4040 27.2452 0.1587 0.07 -0.44 1.36 2.62 2.82 0.19
76 10-207 44 27.2613 27.0516 0.2096         4                                
77 10-209 62 27.5971 27.2494 0.3477     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.46 2 < 0.50 0.73 2 2 27.1712 26.8658 0.3054 0.06 -0.30 1.23 2.38 2.53 0.14
78 10-209 68 26.7453 26.4822 0.2631         4                                
79 10-210 86 25.8713 26.1227 -0.2514     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.43 3 < 0.50 0.32 2 2 25.7073 25.8831 -0.1758 0.11 -0.78 1.71 3.25 3.61 0.36
80 10-210 92 25.5434 25.6436 -0.1002         4                                
81 10-211 110 25.3664 25.6755 -0.3091     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.61 4 < 0.50 0.31 2 2 25.4150 25.6645 -0.2495 0.08 -0.85 1.80 3.46 3.76 0.30
82 10-211 116 25.4636 25.6535 -0.1899         4                                
83 10-215 134 28.7408 29.0779 -0.3371     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 4.17 4 < 0.50 0.12 2 2 28.2091 28.6693 -0.4602 0.17 -1.06 2.09 3.83 4.55 0.71
84 10-215 140 27.6775 28.2608 -0.5833         4                                
85 10-216 158 30.2854 30.3341 -0.0486     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 3.25 3 < 0.50 0.17 2 2 30.0902 30.1876 -0.0973 0.07 -0.70 1.62 3.14 3.36 0.22
86 10-216 164 29.8950 30.0411 -0.1460         4                                
87 10-221a 182 27.6562 27.7129 -0.0567     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.88 3 < 0.50 0.10 2 2 27.5076 27.4339 0.0738 0.18 -0.53 1.44 2.63 3.16 0.52
88 10-221a 188 27.3591 27.1549 0.2042         4                                
89 10-222 206 26.2720 26.9783 -0.7062     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 4.54 5 < 0.50 0.27 2 2 26.0151 26.5951 -0.5800 0.18 -1.18 2.27 4.16 4.95 0.79
90 10-222 212 25.7582 26.2120 -0.4538         4                                
91 10-223c 230 25.4968 25.5307 -0.0339     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.72 3 < 0.50 0.25 2 2 25.7309 25.5721 0.1587 0.27 -0.44 1.36 2.38 3.11 0.73
92 10-223c 236 25.9649 25.6136 0.3513         4                                
93 10-226 254 30.6008 30.5790 0.0219     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.36 2 < 0.50 0.26 2 2 30.4371 30.0756 0.3615 0.48 -0.24 1.18 1.87 2.99 1.12
94 10-226 260 30.2734 29.5723 0.7011         4                                
95 10-228 278 33.8103 33.4664 0.3439 x VICET SMARCE1in10ex10 RNase P 4         2                    
96 10-228 284 33.1333 33.0500 0.0832 x VICET     4                                
97 10-230T 302 29.9956 29.9703 0.0253     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.85 3 < 0.50 0.19 2 2 29.8282 29.7369 0.0913 0.09 -0.51 1.42 2.72 2.98 0.26
98 10-230T 308 29.6608 29.5034 0.1573         4                                
99 10-233 326 35.8217 undetermined undetermined x NOVIC SMARCE1in10ex10 RNase P 4         2                    
100 10-233 332 39.4376 undetermined undetermined x NOVIC     4                                
101 DNActrl 374 25.1265 24.3304 0.7961     SMARCE1in10ex10 RNase P 4 2.00 2 < 0.50 0.13 2 2 24.7272 24.1259 0.6013 0.28 0.00 1.00 1.75 2.29 0.54
102 DNActrl 380 24.3279 23.9215 0.4064         4                                
103 NTC 350 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in10ex10 RNase P 4         2                    
104 NTC 356 undetermined undetermined undetermined x NTC     4