Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin10ex10/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl6_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in10ex10                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl6_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 10:47:46 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 2 Copies: 6                                                    
27 - 3 Copies: 7                                                    
28 - 4 Copies: 4                                                    
29 - 5 Copies: 7                                                    
30 - 6 Copies: 4                                                    
31 - 7 Copies: 2                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.1353                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-281T 2 28.5155 28.8285 -0.3130     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.84 5 < 0.50 0.16 2 2 28.8009 29.1894 -0.3885 0.11 -1.27 2.42 4.59 5.09 0.51
42 10-281T 8 29.0863 29.5503 -0.4639         6                                
43 10-282 26 28.0057 27.5347 0.4710     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.48 2 < 0.50 0.39 2 2 27.7947 27.2223 0.5723 0.14 -0.31 1.24 2.32 2.66 0.35
44 10-282 32 27.5836 26.9099 0.6736         6                                
45 10-283 50 27.5413 26.9406 0.6007     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.78 3 < 0.50 0.09 2 2 27.7786 27.3683 0.4102 0.27 -0.47 1.39 2.44 3.17 0.74
46 10-283 56 28.0158 27.7960 0.2198         6                                
47 10-284 74 28.8572 27.8053 1.0519     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.10 2 < 0.50 0.11 2 2 28.2679 27.4564 0.8116 0.34 -0.07 1.05 1.78 2.49 0.70
48 10-284 80 27.6786 27.1074 0.5712         6                                
49 10-285 98 28.7451 28.0428 0.7023     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.55 3 < 0.50 0.28 2 2 28.6470 28.1106 0.5364 0.23 -0.35 1.27 2.27 2.86 0.59
50 10-285 104 28.5489 28.1784 0.3704         6                                
51 10-286 122 29.6584 29.8475 -0.1891     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 5.16 5 < 0.50 0.11 2 2 29.2024 29.6860 -0.4836 0.42 -1.37 2.58 4.21 6.33 2.12
52 10-286 128 28.7465 29.5246 -0.7781         6                                
53 10-287 146 28.0265 28.0821 -0.0556     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.86 5 < 0.50 0.12 2 2 27.6143 28.0098 -0.3955 0.48 -1.28 2.43 3.84 6.15 2.31
54 10-287 152 27.2021 27.9376 -0.7355         6                                
55 10-288 170 24.6439 24.8255 -0.1815     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 3.82 4 < 0.50 0.11 2 2 24.9132 24.9616 -0.0483 0.19 -0.93 1.91 3.48 4.19 0.71
56 10-288 176 25.1826 25.0977 0.0849         6                                
57 10-290 194 27.9700 27.9993 -0.0293     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.67 5 < 0.50 0.11 2 2 27.4866 27.8249 -0.3383 0.44 -1.22 2.33 3.77 5.79 2.02
58 10-290 200 27.0032 27.6505 -0.6472         6                                
59 10-292 218 26.6007 27.1600 -0.5593     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 5.81 6 < 0.50 0.15 2 2 26.6747 27.3270 -0.6523 0.13 -1.54 2.90 5.44 6.19 0.75
60 10-292 224 26.7488 27.4941 -0.7453         6                                
61 10-293 242 27.7375 27.9534 -0.2159     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.37 4 < 0.50 0.09 2 2 27.6311 27.8740 -0.2429 0.04 -1.13 2.19 4.29 4.45 0.16
62 10-293 248 27.5247 27.7946 -0.2699         6                                
63 10-294 266 27.5652 26.6563 0.9089     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 1.91 2 0.67 0.08 2 2 27.3222 26.3716 0.9506 0.06 0.07 0.96 1.86 1.97 0.11
64 10-294 272 27.0793 26.0870 0.9923         6                                
65 10-296 290 28.2554 27.2142 1.0412     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.08 2 < 0.50 0.11 2 2 28.3870 27.5573 0.8296 0.30 -0.06 1.04 1.79 2.41 0.61
66 10-296 296 28.5186 27.9005 0.6181         6                                
67 10-297 314 28.1055 28.1318 -0.0263     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 3.38 3 < 0.50 0.25 2 2 28.0198 27.8916 0.1282 0.22 -0.76 1.69 3.04 3.76 0.73
68 10-297 320 27.9341 27.6513 0.2828         6                                
69 10-298 14 29.8391 30.0742 -0.2351     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.61 5 < 0.50 0.09 2 2 30.1591 30.4803 -0.3212 0.12 -1.21 2.31 4.35 4.90 0.55
70 10-298 20 30.4791 30.8865 -0.4073         6                                
71 10-299 38 27.8276 27.9969 -0.1693     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.78 5 < 0.50 0.13 2 2 27.4261 27.7969 -0.3709 0.29 -1.26 2.39 4.15 5.49 1.34
72 10-299 44 27.0245 27.5969 -0.5724         6                                
73 10-302 62 26.9786 27.7637 -0.7850     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 5.94 6 < 0.50 0.09 2 2 27.5459 28.2308 -0.6849 0.14 -1.57 2.97 5.54 6.36 0.83
74 10-302 68 28.1132 28.6978 -0.5847         6                                
75 10-306T 86 28.9670 29.7167 -0.7497     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 6.32 6 < 0.50 0.12 2 2 28.8563 29.6307 -0.7744 0.03 -1.66 3.16 6.21 6.43 0.22
76 10-306T 92 28.7455 29.5446 -0.7991         6                                
77 10-307 110 28.7194 28.9200 -0.2006     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.11 4 < 0.50 0.08 2 2 28.7925 28.9457 -0.1532 0.07 -1.04 2.05 3.97 4.24 0.27
78 10-307 116 28.8657 28.9715 -0.1058         6                                
79 10-308 134 27.9313 28.5314 -0.6001     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 5.12 5 < 0.50 0.11 2 2 28.1320 28.6032 -0.4712 0.18 -1.36 2.56 4.68 5.60 0.92
80 10-308 140 28.3326 28.6750 -0.3424         6                                
81 10-309 158 28.7650 28.9094 -0.1445     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 4.02 4 < 0.50 0.08 2 2 28.7474 28.8678 -0.1204 0.03 -1.01 2.01 3.95 4.08 0.13
82 10-309 164 28.7298 28.8262 -0.0963         6                                
83 10-310 182 28.9381 30.4119 -1.4738     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 7.42 7 < 0.50 0.15 2 2 29.2086 30.2150 -1.0063 0.66 -1.89 3.71 5.37 10.26 4.89
84 10-310 188 29.4792 30.0180 -0.5389         6                                
85 10-311 206 27.2065 28.0255 -0.8190     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 5.57 6 < 0.50 0.15 2 2 27.3934 27.9872 -0.5938 0.32 -1.48 2.79 4.77 6.52 1.75
86 10-311 212 27.5804 27.9489 -0.3685         6                                
87 10-313 230 26.9626 27.9528 -0.9902     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 6.71 7 < 0.50 0.23 2 2 27.0166 27.8784 -0.8617 0.18 -1.75 3.36 6.14 7.34 1.20
88 10-313 236 27.0707 27.8039 -0.7333         6                                
89 10-314 254 27.4866 27.4315 0.0551     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 3.42 3 < 0.50 0.16 2 2 27.7749 27.6628 0.1121 0.08 -0.77 1.71 3.29 3.56 0.27
90 10-314 260 28.0631 27.8941 0.1690         6                                
91 10-316 278 27.8638 27.4090 0.4548     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.92 3 < 0.50 0.08 2 2 27.5089 27.1712 0.3377 0.17 -0.55 1.46 2.69 3.17 0.48
92 10-316 284 27.1540 26.9334 0.2206         6                                
93 10-321 302 27.9180 27.3524 0.5656     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.46 2 < 0.50 0.50 2 2 28.1719 27.5834 0.5884 0.03 -0.30 1.23 2.42 2.50 0.08
94 10-321 308 28.4258 27.8145 0.6113         6                                
95 10-322 326 28.7276 28.2652 0.4624     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.62 3 < 0.50 0.32 2 2 28.5850 28.0899 0.4951 0.05 -0.39 1.31 2.56 2.68 0.12
96 10-322 332 28.4425 27.9146 0.5278         6                                
97 10-323 350 33.3170 33.6154 -0.2984 x VICET SMARCE1in10ex10 RNase P 6         2                    
98 10-323 356 34.3637 36.0321 -1.6684 x VICET     6                                
99 10-324 374 28.8301 28.4684 0.3616     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.92 3 < 0.50 0.09 2 2 28.7762 28.4358 0.3404 0.03 -0.54 1.46 2.87 2.96 0.09
100 10-324 380 28.7223 28.4031 0.3192         6                                
101 DNActrl 362 24.9723 24.0617 0.9106     SMARCE1in10ex10 RNase P 6 2.00 2 0.55 0.10 2 2 24.8296 23.9445 0.8851 0.04 0.00 1.00 1.96 2.04 0.07
102 DNActrl 368 24.6869 23.8273 0.8596         6                                
103 NTC 338 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in10ex10 RNase P 6         2                    
104 NTC 344 undetermined undetermined undetermined x NTC     6