Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl12_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in3ex3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl12_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 11:35:02 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 13                                                    
27 - 2 Copies: 12                                                    
28 - 3 Copies: 3                                                    
29 - 4 Copies: 1                                                    
30 - 6 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 5                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
34 - Outlier determined by the software: 1                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37 Delta Ct variance: 0.2499                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-679 1 29.3654 27.7489 1.6166     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.00 1 0.91 0.07 2 2 29.5165 27.9284 1.5881 0.04 1.00 0.50 0.98 1.02 0.04
42 10-679 7 29.6676 28.1080 1.5596         12                                
43 10-680 25 29.0951 28.2713 0.8238     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.39 1 < 0.50 0.29 2 2 29.7356 28.6189 1.1167 0.41 0.53 0.69 1.13 1.70 0.57
44 10-680 31 30.3760 28.9665 1.4096         12                                
45 10-686 49 30.3058 29.2330 1.0728     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.10 1 0.59 0.09 2 2 30.8890 29.4313 1.4577 0.54 0.87 0.55 0.84 1.43 0.59
46 10-686 55 31.4722 29.6296 1.8426         12                                
47 10-687 73 27.1741 26.3616 0.8125     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.66 2 < 0.50 0.45 2 2 27.4650 26.6015 0.8635 0.07 0.27 0.83 1.60 1.72 0.12
48 10-687 79 27.7559 26.8415 0.9144         12                                
49 10-689 97 30.0421 28.6731 1.3689     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.28 1 < 0.50 0.17 2 2 29.8756 28.6431 1.2326 0.19 0.64 0.64 1.17 1.41 0.24
50 10-689 103 29.7092 28.6130 1.0962         12                                
51 10-691 121 30.3896 29.1256 1.2640     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.30 1 < 0.50 0.28 2 2 30.2946 29.0834 1.2112 0.07 0.62 0.65 1.25 1.35 0.10
52 10-691 127 30.1996 29.0412 1.1584         12                                
53 10-694 145 34.6938 32.4855 2.2083     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 0.88 1 0.97 0.23 2 2 34.4180 32.6397 1.7783 0.61 1.19 0.44 0.65 1.18 0.53
54 10-694 151 34.1422 32.7939 1.3484         12                                
55 10-695 169 32.1148 31.8687 0.2461     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.54 3 < 0.50 0.16 2 1 32.1148 31.8687 0.2461 0.00 -0.34 1.27 2.54 2.54 0.00
56 10-695 175 31.7783 20.4442 11.3341 x OCONF     12                                
57 10-696 193 33.7635 31.5241 2.2394     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 0.78 1 0.99 0.52 2 2 33.5251 31.5739 1.9513 0.41 1.36 0.39 0.64 0.95 0.31
58 10-696 199 33.2868 31.6237 1.6631         12                                
59 10-698 217 30.7416 30.2040 0.5377     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.50 1 < 0.50 0.42 2 2 31.5838 30.5736 1.0102 0.67 0.42 0.75 1.08 2.08 1.00
60 10-698 223 32.4259 30.9432 1.4827         12                                
61 10-700 241 31.5762 30.6976 0.8786     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.74 2 < 0.50 0.16 2 2 31.4336 30.6452 0.7884 0.13 0.20 0.87 1.64 1.86 0.22
62 10-700 247 31.2910 30.5928 0.6981         12                                
63 10-702 265 30.1612 28.6626 1.4986     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 0.94 1 0.97 0.06 2 2 30.6115 28.9326 1.6789 0.26 1.09 0.47 0.83 1.07 0.24
64 10-702 271 31.0619 29.2026 1.8593         12                                
65 10-706 289 29.2601 27.4673 1.7928     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 0.92 1 0.97 0.10 2 2 29.2772 27.5689 1.7082 0.12 1.12 0.46 0.87 0.98 0.11
66 10-706 295 29.2943 27.6706 1.6237         12                                
67 10-707 313 32.8831 31.7960 1.0871     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.31 1 < 0.50 0.23 2 2 32.8749 31.6774 1.1975 0.16 0.61 0.66 1.22 1.42 0.20
68 10-707 319 32.8668 31.5589 1.3079         12                                
69 10-709 13 28.6590 27.2135 1.4454     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.29 1 < 0.50 0.11 2 2 28.2715 27.0443 1.2272 0.31 0.64 0.64 1.11 1.50 0.39
70 10-709 19 27.8839 26.8750 1.0089         12                                
71 10-710 37 29.4878 30.8691 -1.3813     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 6.37 6 < 0.50 0.06 2 2 29.7085 30.7888 -1.0804 0.43 -1.67 3.19 5.17 7.85 2.68
72 10-710 43 29.9291 30.7085 -0.7794         12                                
73 10-713 61 31.8598 31.4838 0.3760     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.96 2 0.61 0.05 2 2 31.6508 31.0311 0.6197 0.34 0.03 0.98 1.66 2.32 0.67
74 10-713 67 31.4418 30.5784 0.8635         12                                
75 10-715 85 26.9727 26.6027 0.3700     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.36 2 0.59 0.11 2 2 27.0183 26.6686 0.3497 0.03 -0.24 1.18 2.33 2.40 0.07
76 10-715 91 27.0638 26.7345 0.3293         12                                
77 10-716 109 29.0600 28.5795 0.4805     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.91 2 < 0.50 0.12 2 2 28.8505 28.1961 0.6544 0.25 0.06 0.96 1.70 2.16 0.46
78 10-716 115 28.6411 27.8128 0.8284         12                                
79 10-717 133 29.1104 28.3931 0.7174     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.94 2 0.55 0.10 2 2 28.9781 28.3464 0.6317 0.12 0.04 0.97 1.83 2.06 0.23
80 10-717 139 28.8459 28.2997 0.5461         12                                
81 10-722T 157 29.0289 28.8331 0.1959     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.27 2 0.63 0.06 2 2 29.1507 28.7418 0.4088 0.30 -0.18 1.13 1.96 2.63 0.67
82 10-722T 163 29.2724 28.6506 0.6218         12                                
83 10-726 181 33.2964 33.1744 0.1220 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 12         2                    
84 10-726 187 33.2571 33.2522 0.0049 x VICET     12                                
85 10-730 205 28.8652 28.3177 0.5475     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.12 2 0.63 0.06 2 2 29.0417 28.5322 0.5095 0.05 -0.08 1.06 2.06 2.17 0.11
86 10-730 211 29.2182 28.7468 0.4714         12                                
87 10-731 229 27.5024 27.7665 -0.2641     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.91 3 < 0.50 0.08 2 2 28.3266 28.2787 0.0479 0.44 -0.54 1.46 2.35 3.62 1.27
88 10-731 235 29.1508 28.7909 0.3599         12                                
89 10-732 253 28.0023 27.7118 0.2905     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.35 2 0.56 0.09 2 2 28.1947 27.8366 0.3581 0.10 -0.23 1.18 2.24 2.46 0.22
90 10-732 259 28.3871 27.9615 0.4256         12                                
91 10-733 277 26.6700 26.7631 -0.0931     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 3.03 3 < 0.50 0.06 2 2 26.9640 26.9733 -0.0093 0.12 -0.60 1.52 2.86 3.21 0.35
92 10-733 283 27.2581 27.1836 0.0745         12                                
93 10-734 301 31.6140 32.2294 -0.6153     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 4.26 4 < 0.50 0.06 2 2 31.6425 32.1425 -0.5000 0.16 -1.09 2.13 3.93 4.61 0.68
94 10-734 307 31.6710 32.0556 -0.3846         12                                
95 10-735 325 32.4354 31.3124 1.1230     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.51 2 < 0.50 0.71 2 2 32.0388 31.0392 0.9997 0.17 0.41 0.75 1.38 1.64 0.26
96 10-735 331 31.6422 30.7659 0.8763         12                                
97 10-738 349 30.7337 29.4940 1.2396     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.06 1 0.72 0.07 2 2 30.9483 29.4455 1.5028 0.37 0.91 0.53 0.89 1.28 0.39
98 10-738 355 31.1629 29.3970 1.7659         12                                
99 10-739 373 30.4842 29.3616 1.1226     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 1.62 2 < 0.50 0.49 2 2 30.4574 29.5612 0.8963 0.32 0.31 0.81 1.38 1.89 0.51
100 10-739 379 30.4306 29.7607 0.6699         12                                
101 DNActrl 361 25.0066 24.4759 0.5307     SMARCE1in3ex3 RNase P 12 2.00 2 0.57 0.06 2 2 24.8589 24.2680 0.5909 0.09 0.00 1.00 1.92 2.09 0.17
102 DNActrl 367 24.7112 24.0601 0.6511         12                                
103 NTC 337 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in3ex3 RNase P 12         2                    
104 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC     12