Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120921_1000_3rdset_pl13_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in3ex3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120921_1000_3rdset_pl13_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/21/12 1:41:34 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 3                                                    
26 - 0 Copy: 2                                                    
27 - 1 Copy: 19                                                    
28 - 2 Copies: 7                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 8                                                    
31 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 6                                                    
32 - Negative control sample well: 2                                                    
33                                                      
34 Delta Ct variance: 0.3126                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-747 1 35.7600 32.9862 2.7738     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.71 1 0.93 0.35 2 2 33.6932 31.5212 2.1721 0.85 1.49 0.36 0.47 1.08 0.61
39 10-747 7 31.6265 30.0561 1.5704         13                                
40 10-748 25 32.5950 30.0795 2.5155     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.82 1 0.85 0.11 2 2 31.5414 29.5688 1.9727 0.77 1.29 0.41 0.56 1.19 0.63
41 10-748 31 30.4879 29.0581 1.4298         13                                
42 10-749 49 31.6891 30.9066 0.7825     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.95 2 < 0.50 0.08 2 2 31.6953 30.9770 0.7184 0.09 0.04 0.98 1.87 2.04 0.17
43 10-749 55 31.7016 31.0474 0.6542         13                                
44 10-750 73 32.5170 30.8811 1.6359     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.25 1 < 0.50 0.20 2 2 31.6091 30.2480 1.3610 0.39 0.68 0.62 1.03 1.51 0.48
45 10-750 79 30.7011 29.6150 1.0861         13                                
46 10-754 97 35.7874 33.7353 2.0522 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 13         2                    
47 10-754 103 34.8801 33.6015 1.2786 x VICET     13                                
48 10-756 121 31.2941 29.7834 1.5107     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.32 1 < 0.50 0.27 2 2 30.5190 29.2318 1.2872 0.32 0.60 0.66 1.13 1.54 0.41
49 10-756 127 29.7439 28.6803 1.0636         13                                
50 10-760 145 33.2787 31.2623 2.0164     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.84 1 0.76 0.07 2 2 33.0166 31.0854 1.9312 0.12 1.25 0.42 0.79 0.89 0.10
51 10-760 151 32.7546 30.9085 1.8461         13                                
52 10-765 169 32.9633 31.8542 1.1091     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.47 1 < 0.50 0.58 2 2 32.8332 31.7067 1.1264 0.02 0.44 0.74 1.45 1.49 0.04
53 10-765 175 32.7030 31.5593 1.1438         13                                
54 10-766 193 35.6434 32.7916 2.8518     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.73 1 0.91 0.22 2 2 34.4245 32.2947 2.1298 1.02 1.45 0.37 0.44 1.21 0.77
55 10-766 199 33.2056 31.7979 1.4077         13                                
56 10-768 217 35.2014 32.3896 2.8117     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.39 0     2 2 35.0187 31.9877 3.0310 0.31 2.35 0.20 0.34 0.46 0.12
57 10-768 223 34.8360 31.5858 3.2502         13                                
58 10-769 241 35.3652 32.7290 2.6362     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.49 0     2 2 35.2690 32.5476 2.7214 0.12 2.04 0.24 0.46 0.52 0.06
59 10-769 247 35.1728 32.3662 2.8066         13                                
60 10-771 265 38.0017 35.7976 2.2040 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 13         2                    
61 10-771 271 undetermined 36.1949 undetermined x VICET     13                                
62 10-773 289 31.7383 29.4935 2.2448     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.85 1 0.84 0.17 2 2 30.8615 28.9465 1.9150 0.47 1.23 0.43 0.68 1.07 0.39
63 10-773 295 29.9847 28.3995 1.5852         13                                
64 10-775 313 31.4243 30.1188 1.3055     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.70 2 < 0.50 0.11 2 2 30.5737 29.6585 0.9152 0.55 0.23 0.85 1.30 2.23 0.93
65 10-775 319 29.7231 29.1983 0.5248         13                                
66 10-779 13 30.9481 29.9617 0.9865     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.83 2 < 0.50 0.09 2 2 30.3482 29.5406 0.8076 0.25 0.12 0.92 1.62 2.08 0.46
67 10-779 19 29.7482 29.1195 0.6287         13                                
68 10-781 37 30.9304 29.6407 1.2897     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.21 1 < 0.50 0.23 2 2 30.2948 28.8827 1.4120 0.17 0.73 0.60 1.11 1.31 0.20
69 10-781 43 29.6591 28.1247 1.5344         13                                
70 10-784 61 30.0437 28.8551 1.1886     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.30 1 < 0.50 0.40 2 2 30.0354 28.7309 1.3045 0.16 0.62 0.65 1.20 1.41 0.21
71 10-784 67 30.0272 28.6066 1.4205         13                                
72 10-785 85 33.0651 32.3456 0.7195     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 2.06 2 < 0.50 0.07 2 2 32.0079 31.3692 0.6387 0.11 -0.04 1.03 1.95 2.18 0.23
73 10-785 91 30.9507 30.3928 0.5579         13                                
74 10-786 109 31.6763 30.1237 1.5527     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.10 1 0.67 0.12 2 2 31.8702 30.3269 1.5433 0.01 0.86 0.55 1.09 1.11 0.01
75 10-786 115 32.0641 30.5301 1.5340         13                                
76 10-789 133 35.8122 33.8841 1.9280 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 13         2                    
77 10-789 139 35.7470 33.9156 1.8313 x VICET     13                                
78 10-791 157 32.4249 30.6651 1.7598     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.07 1 0.70 0.10 2 2 31.9144 30.3238 1.5906 0.24 0.91 0.53 0.95 1.20 0.25
79 10-791 163 31.4038 29.9824 1.4214         13                                
80 10-792 181 31.0846 29.3992 1.6854     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.28 1 < 0.50 0.22 2 2 30.5155 29.1872 1.3282 0.51 0.65 0.64 1.00 1.64 0.64
81 10-792 187 29.9463 28.9753 0.9710         13                                
82 10-793 205 31.0371 30.3235 0.7136     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.95 2 < 0.50 0.06 2 2 30.5948 29.8758 0.7191 0.01 0.04 0.98 1.94 1.96 0.01
83 10-793 211 30.1526 29.4281 0.7246         13                                
84 10-795a 229 29.7511 28.8656 0.8854     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.79 2 < 0.50 0.10 2 2 29.6465 28.8016 0.8449 0.06 0.16 0.89 1.74 1.84 0.10
85 10-795a 235 29.5419 28.7375 0.8044         13                                
86 10-797 253 32.4768 30.0888 2.3879     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.91 1 0.74 0.11 2 2 31.3366 29.5232 1.8133 0.81 1.13 0.46 0.61 1.36 0.75
87 10-797 259 30.1964 28.9576 1.2387         13                                
88 10-800 277 30.6003 28.6607 1.9396     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.99 1 0.79 0.07 2 2 30.3006 28.6036 1.6970 0.34 1.01 0.50 0.84 1.17 0.33
89 10-800 283 30.0009 28.5465 1.4544         13                                
90 10-803 301 33.2304 30.9308 2.2995     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.86 1 0.88 0.14 2 2 32.7062 30.8034 1.9028 0.56 1.22 0.43 0.65 1.13 0.48
91 10-803 307 32.1820 30.6760 1.5061         13                                
92 10-805 325 34.2228 31.2969 2.9259     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.70 1 0.95 0.33 2 2 32.9307 30.7295 2.2012 1.02 1.52 0.35 0.42 1.15 0.73
93 10-805 331 31.6386 30.1621 1.4765         13                                
94 10-807 349 33.2229 30.2595 2.9634     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 0.66 1 0.95 0.54 2 2 32.6828 30.4072 2.2756 0.97 1.59 0.33 0.41 1.07 0.66
95 10-807 355 32.1428 30.5549 1.5879         13                                
96 10-808 373 33.5609 31.5231 2.0378     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 1.14 1 < 0.50 0.10 2 2 32.7609 31.2683 1.4927 0.77 0.81 0.57 0.78 1.66 0.88
97 10-808 379 31.9610 31.0135 0.9475         13                                
98 DNActrl 361 26.5628 25.3591 1.2037     SMARCE1in3ex3 RNase P 13 2.00 2 < 0.50 0.11 2 2 25.4742 24.7913 0.6828 0.74 0.00 1.00 1.39 2.87 1.48
99 DNActrl 367 24.3856 24.2236 0.1620         13                                
100 NTC 337 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in3ex3 RNase P 13         2                    
101 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC     13