Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl6_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in3ex3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl6_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 10:47:46 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 1                                                    
26 - 1 Copy: 8                                                    
27 - 2 Copies: 16                                                    
28 - 3 Copies: 3                                                    
29 - 4 Copies: 3                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
32 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.2250                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-281T 1 31.4171 30.2969 1.1203     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.96 2 0.68 0.09 2 2 30.7810 30.0327 0.7483 0.53 0.03 0.98 1.52 2.54 1.02
41 10-281T 7 30.1448 29.7685 0.3763         6                                
42 10-282 25 27.9705 27.0492 0.9214     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.52 2 < 0.50 0.72 2 2 28.5451 27.4311 1.1139 0.27 0.39 0.76 1.33 1.74 0.41
43 10-282 31 29.1197 27.8131 1.3065         6                                
44 10-283 49 30.2568 28.2929 1.9639     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 0.85 1 0.90 0.20 2 2 30.0925 28.1308 1.9617 0.00 1.24 0.42 0.85 0.85 0.00
45 10-283 55 29.9281 27.9688 1.9594         6                                
46 10-284 73 29.1727 28.4366 0.7361     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.51 3 < 0.50 0.19 2 2 28.5502 28.1562 0.3940 0.48 -0.33 1.25 1.98 3.18 1.20
47 10-284 79 27.9277 27.8759 0.0519         6                                
48 10-285 97 30.9323 29.0516 1.8807     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 0.98 1 0.80 0.04 2 2 30.6201 28.8675 1.7526 0.18 1.03 0.49 0.90 1.07 0.17
49 10-285 103 30.3079 28.6834 1.6245         6                                
50 10-286 121 31.9921 30.4376 1.5546     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.33 1 < 0.50 0.42 2 2 31.6679 30.3527 1.3152 0.34 0.59 0.66 1.12 1.56 0.44
51 10-286 127 31.3437 30.2679 1.0758         6                                
52 10-287 145 28.8723 27.9614 0.9109     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.76 2 0.72 0.18 2 2 28.9484 28.0393 0.9092 0.00 0.19 0.88 1.75 1.76 0.00
53 10-287 151 29.0246 28.1171 0.9074         6                                
54 10-288 169 27.4340 26.4662 0.9678     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.13 2 0.58 0.10 2 2 26.5913 25.9637 0.6277 0.48 -0.09 1.07 1.69 2.70 1.02
55 10-288 175 25.7486 25.4611 0.2875         6                                
56 10-290 193 29.7729 28.3802 1.3927     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.41 1 < 0.50 1.01 2 2 29.3171 28.0922 1.2249 0.24 0.50 0.71 1.26 1.58 0.33
57 10-290 199 28.8614 27.8042 1.0572         6                                
58 10-292 217 28.2243 27.7949 0.4294     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.58 3 < 0.50 0.24 2 2 28.3189 27.9628 0.3561 0.10 -0.37 1.29 2.45 2.71 0.26
59 10-292 223 28.4135 28.1307 0.2828         6                                
60 10-293 241 29.9502 28.8207 1.1296     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.85 2 0.69 0.07 2 2 29.3900 28.5558 0.8341 0.42 0.11 0.92 1.51 2.27 0.76
61 10-293 247 28.8297 28.2910 0.5387         6                                
62 10-294 265 29.1804 27.5593 1.6212     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.14 1 < 0.50 0.27 2 2 28.8196 27.2907 1.5289 0.13 0.81 0.57 1.07 1.22 0.15
63 10-294 271 28.4587 27.0221 1.4366         6                                
64 10-296 289 30.0809 28.2394 1.8415     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.10 1 < 0.50 0.19 2 2 29.7100 28.1218 1.5882 0.36 0.87 0.55 0.92 1.31 0.39
65 10-296 295 29.3390 28.0042 1.3349         6                                
66 10-297 313 30.1371 29.0105 1.1266     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.74 2 0.74 0.10 2 2 29.5544 28.6305 0.9238 0.29 0.20 0.87 1.51 2.00 0.49
67 10-297 319 28.9716 28.2506 0.7210         6                                
68 10-298 13 31.1534 30.9581 0.1953     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 3.55 4 < 0.50 0.11 2 2 30.8790 30.9856 -0.1066 0.43 -0.83 1.78 2.88 4.38 1.50
69 10-298 19 30.6047 31.0132 -0.4085         6                                
70 10-299 37 28.1619 28.0824 0.0795     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 3.35 3 < 0.50 0.16 2 2 28.2597 28.2841 -0.0243 0.15 -0.75 1.68 3.12 3.60 0.48
71 10-299 43 28.3575 28.4857 -0.1281         6                                
72 10-302 61 29.4235 28.9050 0.5185     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.25 2 0.66 0.12 2 2 29.4883 28.9372 0.5511 0.05 -0.17 1.13 2.20 2.30 0.10
73 10-302 67 29.5532 28.9695 0.5837         6                                
74 10-306T 85 31.2722 30.7250 0.5472     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.31 2 0.56 0.19 2 2 31.1245 30.6135 0.5110 0.05 -0.21 1.16 2.26 2.37 0.12
75 10-306T 91 30.9769 30.5021 0.4749         6                                
76 10-307 109 30.5806 29.8304 0.7502     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.11 2 0.59 0.11 2 2 30.1525 29.5069 0.6456 0.15 -0.08 1.05 1.96 2.27 0.31
77 10-307 115 29.7244 29.1835 0.5410         6                                
78 10-308 133 29.1347 29.0006 0.1341     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.30 2 < 0.50 0.09 2 2 29.5161 28.9939 0.5222 0.55 -0.20 1.15 1.75 3.00 1.25
79 10-308 139 29.8975 28.9873 0.9102         6                                
80 10-309 157 30.4084 29.4073 1.0011     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.64 2 0.52 0.31 2 2 30.2067 29.1991 1.0076 0.01 0.29 0.82 1.63 1.65 0.01
81 10-309 163 30.0051 28.9910 1.0140         6                                
82 10-310 181 30.4703 30.8507 -0.3804     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 3.74 4 < 0.50 0.11 2 2 30.7497 30.9309 -0.1812 0.28 -0.90 1.87 3.26 4.29 1.04
83 10-310 187 31.0292 31.0111 0.0181         6                                
84 10-311 205 29.5256 29.1716 0.3540     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.46 2 < 0.50 0.44 2 2 29.2327 28.8113 0.4214 0.10 -0.30 1.23 2.35 2.58 0.23
85 10-311 211 28.9398 28.4509 0.4888         6                                
86 10-313 229 28.0873 28.5647 -0.4774     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 3.78 4 < 0.50 0.09 2 2 28.4850 28.6830 -0.1980 0.40 -0.92 1.89 3.12 4.59 1.47
87 10-313 235 28.8826 28.8012 0.0814         6                                
88 10-314 253 28.2944 27.9933 0.3011     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.26 2 0.61 0.10 2 2 28.5737 28.0291 0.5446 0.34 -0.18 1.13 1.91 2.68 0.77
89 10-314 259 28.8529 28.0649 0.7880         6                                
90 10-316 277 28.2822 27.3283 0.9539     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.44 1 < 0.50 1.19 2 2 28.4468 27.2522 1.1946 0.34 0.47 0.72 1.22 1.70 0.48
91 10-316 283 28.6115 27.1761 1.4354         6                                
92 10-321 301 29.9219 28.4789 1.4430     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.50 2 < 0.50 0.43 2 2 29.5176 28.3820 1.1356 0.43 0.41 0.75 1.21 1.86 0.64
93 10-321 307 29.1133 28.2850 0.8283         6                                
94 10-322 325 30.9079 29.1383 1.7695     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 1.23 1 < 0.50 0.15 2 2 30.2671 28.8436 1.4236 0.49 0.70 0.61 0.97 1.56 0.60
95 10-322 331 29.6264 28.5488 1.0776         6                                
96 10-323 349 39.7491 undetermined undetermined x NOVIC SMARCE1in3ex3 RNase P 6         2                    
97 10-323 355 38.1813 37.6756 0.5057 x VICET     6                                
98 10-324 373 30.7691 29.9253 0.8439     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.19 2 0.65 0.08 2 2 30.1811 29.5884 0.5928 0.36 -0.13 1.09 1.84 2.60 0.76
99 10-324 379 29.5931 29.2514 0.3417         6                                
100 DNActrl 361 26.5022 25.3117 1.1905     SMARCE1in3ex3 RNase P 6 2.00 2 0.67 0.07 2 2 25.4734 24.7521 0.7214 0.66 0.00 1.00 1.44 2.77 1.32
101 DNActrl 367 24.4446 24.1924 0.2522         6                                
102 NTC 337 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in3ex3 RNase P 6         2                    
103 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC     6