Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/SMARCEin3ex3/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120919_1000_3rdset_pl7_01.txt                                                    
5 Target name: SMARCE1in3ex3                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120919_1000_3rdset_pl7_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/19/12 12:38:31 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 32                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - Undetermined: 4                                                    
26 - 1 Copy: 18                                                    
27 - 2 Copies: 8                                                    
28 - 3 Copies: 1                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 10                                                    
31 - Undetermined VIC Ct: 2                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 6                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35 Delta Ct variance: 0.3595                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-327 1 undetermined 36.2676 undetermined x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 7         2                    
40 10-327 7 34.6914 33.9720 0.7194 x VICET     7                                
41 10-329 25 34.9567 31.8918 3.0649     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.51 1 0.98 0.80 2 2 34.0780 31.4743 2.6037 0.65 1.97 0.25 0.37 0.70 0.33
42 10-329 31 33.1993 31.0568 2.1425         7                                
43 10-330 49 33.5232 30.9700 2.5532     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.88 1 0.70 0.10 2 2 32.3774 30.5592 1.8182 1.04 1.19 0.44 0.53 1.46 0.93
44 10-330 55 31.2315 30.1483 1.0832         7                                
45 10-331 73 34.3391 31.8727 2.4664     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.78 1 0.80 0.08 2 2 33.1248 31.1264 1.9984 0.66 1.37 0.39 0.56 1.07 0.51
46 10-331 79 31.9105 30.3802 1.5303         7                                
47 10-333 97 33.2421 30.6058 2.6363     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.58 1 0.94 0.44 2 2 33.2175 30.7945 2.4230 0.30 1.79 0.29 0.50 0.67 0.17
48 10-333 103 33.1929 30.9833 2.2096         7                                
49 10-335 121 35.3827 32.8196 2.5632     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.01 1 0.53 0.11 2 2 33.1000 31.4790 1.6210 1.33 0.99 0.50 0.52 1.94 1.41
50 10-335 127 30.8173 30.1385 0.6788         7                                
51 10-336 145 32.5061 30.3836 2.1225     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.03 1 0.54 0.11 2 2 32.0102 30.4150 1.5952 0.75 0.96 0.51 0.71 1.48 0.77
52 10-336 151 31.5143 30.4464 1.0679         7                                
53 10-337 169 33.0711 31.5180 1.5531     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.35 1 < 0.50 0.22 2 2 32.3406 31.1399 1.2008 0.50 0.57 0.67 1.06 1.72 0.67
54 10-337 175 31.6102 30.7617 0.8485         7                                
55 10-338 193 32.5267 31.1395 1.3872     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.72 2 < 0.50 0.09 2 2 31.2191 30.3724 0.8467 0.76 0.21 0.86 1.19 2.51 1.32
56 10-338 199 29.9116 29.6053 0.3063         7                                
57 10-339 217 33.2493 31.7970 1.4523     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.97 1 0.67 0.08 2 2 33.2948 31.6118 1.6829 0.33 1.05 0.48 0.82 1.13 0.31
58 10-339 223 33.3402 31.4267 1.9135         7                                
59 10-340 241 34.7132 32.9494 1.7638     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.68 2 < 0.50 0.13 2 2 32.6815 31.7977 0.8838 1.24 0.25 0.84 0.91 3.09 2.18
60 10-340 247 30.6497 30.6460 0.0037         7                                
61 10-341 265 37.7547 36.5871 1.1676 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 7         2                    
62 10-341 271 39.9871 36.1331 3.8540 x VICET     7                                
63 10-342 289 32.7354 30.5815 2.1539     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.99 1 0.52 0.11 2 2 31.3318 29.6824 1.6494 0.71 1.02 0.49 0.70 1.40 0.71
64 10-342 295 29.9282 28.7833 1.1449         7                                
65 10-343 313 38.0182 34.9265 3.0917 x VICET SMARCE1in3ex3 RNase P 7         2                    
66 10-343 319 34.8936 33.4415 1.4522 x VICET     7                                
67 10-346 13 30.4281 29.3941 1.0341     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.79 2 < 0.50 0.15 2 2 30.3904 29.5989 0.7915 0.34 0.16 0.90 1.51 2.12 0.61
68 10-346 19 30.3527 29.8038 0.5488         7                                
69 10-347 37 28.9876 27.7722 1.2154     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.32 1 < 0.50 0.48 2 2 29.1389 27.9098 1.2291 0.02 0.60 0.66 1.31 1.33 0.03
70 10-347 43 29.2902 28.0474 1.2427         7                                
71 10-348 61 30.0092 29.4220 0.5873     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 2.32 2 0.51 0.13 2 2 29.6527 29.2363 0.4164 0.24 -0.22 1.16 2.06 2.61 0.55
72 10-348 67 29.2962 29.0507 0.2456         7                                
73 10-349 85 29.3963 29.3115 0.0848     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 2.90 3 < 0.50 0.10 2 2 28.9643 28.8683 0.0961 0.02 -0.54 1.45 2.88 2.92 0.05
74 10-349 91 28.5324 28.4251 0.1073         7                                
75 10-353 109 35.9023 undetermined undetermined x NOVIC SMARCE1in3ex3 RNase P 7         2                    
76 10-353 115 undetermined undetermined undetermined x NOVIC     7                                
77 10-356 133 33.1716 31.7543 1.4173     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.08 1 < 0.50 0.18 2 2 32.3196 30.7958 1.5237 0.15 0.89 0.54 1.00 1.16 0.16
78 10-356 139 31.4676 29.8374 1.6302         7                                
79 10-357 157 32.2040 30.4148 1.7892     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.14 1 0.50 0.14 2 2 31.9149 30.4676 1.4472 0.48 0.82 0.57 0.90 1.44 0.54
80 10-357 163 31.6257 30.5204 1.1053         7                                
81 10-359 181 32.9675 31.6388 1.3287     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.95 1 0.72 0.08 2 2 33.2717 31.5709 1.7008 0.53 1.07 0.48 0.74 1.23 0.50
82 10-359 187 33.5760 31.5031 2.0730         7                                
83 10-360 205 29.4508 28.0179 1.4328     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.31 1 < 0.50 0.32 2 2 28.7436 27.4977 1.2459 0.26 0.61 0.65 1.15 1.49 0.34
84 10-360 211 28.0364 26.9774 1.0590         7                                
85 10-361 229 29.7825 27.6796 2.1030     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.71 1 0.92 0.20 2 2 29.7199 27.5900 2.1300 0.04 1.50 0.35 0.70 0.72 0.03
86 10-361 235 29.6573 27.5004 2.1570         7                                
87 10-363 253 33.2879 32.4504 0.8375     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 2.04 2 < 0.50 0.06 2 2 32.5225 31.9186 0.6039 0.33 -0.03 1.02 1.73 2.40 0.66
88 10-363 259 31.7570 31.3867 0.3703         7                                
89 10-364 277 29.1051 26.8390 2.2661     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.63 1 0.93 0.59 2 2 29.5189 27.2140 2.3049 0.05 1.67 0.31 0.61 0.64 0.03
90 10-364 283 29.9327 27.5890 2.3436         7                                
91 10-369 301 32.9469 32.0685 0.8784     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 2.41 2 < 0.50 0.13 2 2 31.8685 31.5054 0.3631 0.73 -0.27 1.20 1.69 3.44 1.76
92 10-369 307 30.7901 30.9422 -0.1521         7                                
93 10-374 325 32.4047 30.1255 2.2792     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 0.74 1 0.88 0.21 2 2 31.3141 29.2451 2.0691 0.30 1.44 0.37 0.64 0.85 0.22
94 10-374 331 30.2235 28.3647 1.8589         7                                
95 10-376 349 31.4493 29.8023 1.6470     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.18 1 < 0.50 0.25 2 2 31.2194 29.8204 1.3990 0.35 0.77 0.59 0.99 1.40 0.41
96 10-376 355 30.9896 29.8385 1.1511         7                                
97 10-377 373 32.7702 31.5787 1.1914     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 1.77 2 < 0.50 0.12 2 2 32.0305 31.2226 0.8078 0.54 0.18 0.89 1.36 2.31 0.95
98 10-377 379 31.2908 30.8665 0.4243         7                                
99 DNActrl 361 29.0927 27.9026 1.1901     SMARCE1in3ex3 RNase P 7 2.00 2 < 0.50 0.07 2 2 27.8600 27.2279 0.6321 0.79 0.00 1.00 1.36 2.94 1.59
100 DNActrl 367 26.6273 26.5531 0.0742         7                                
101 NTC 337 undetermined undetermined undetermined x NTC SMARCE1in3ex3 RNase P 7         2                    
102 NTC 343 undetermined undetermined undetermined x NTC     7