Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl25_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex13in13                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl25_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 12:09:18 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 2                                                    
28 - 3 Copies: 5                                                    
29 - 4 Copies: 1                                                    
30 - 5 Copies: 1                                                    
31 - 8 Copies: 1                                                    
32 - 10 Copies: 1                                                    
33 > 10 Copies: 4                                                    
34                                                      
35 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-689 6 28.4791 29.2197 -0.7406     STARD3ex13in13 RNase P 25 3.20 3     2 2 27.6655 28.6405 -0.9750 0.33 -0.68 1.60 2.72 3.76 1.04
41 10-689 18 26.8520 28.0613 -1.2093         25                                
42 10-691 30 27.6320 28.6748 -1.0428     STARD3ex13in13 RNase P 25 3.10 3     2 2 27.4216 28.3511 -0.9295 0.16 -0.63 1.55 2.87 3.35 0.49
43 10-691 42 27.2113 28.0274 -0.8161         25                                
44 10-694 54 29.2799 31.9037 -2.6238     STARD3ex13in13 RNase P 25 8.23 8     2 2 29.3602 31.6983 -2.3381 0.40 -2.04 4.12 6.75 10.04 3.28
45 10-694 66 29.4404 31.4928 -2.0524         25                                
46 10-695 78 27.8765 30.4780 -2.6015     STARD3ex13in13 RNase P 25 10.31 10     2 2 27.5297 30.1929 -2.6633 0.09 -2.37 5.16 9.88 10.77 0.88
47 10-695 90 27.1829 29.9079 -2.7250         25                                
48 10-696 102 27.5375 31.1025 -3.5649     STARD3ex13in13 RNase P 25 20.75 21     2 2 27.5700 31.2418 -3.6718 0.15 -3.38 10.38 19.27 22.35 3.08
49 10-696 114 27.6024 31.3812 -3.7788         25                                
50 10-698 126 29.7753 31.3172 -1.5418     STARD3ex13in13 RNase P 25 4.98 5     2 2 28.9069 30.5184 -1.6115 0.10 -1.31 2.49 4.74 5.22 0.48
51 10-698 138 28.0384 29.7195 -1.6812         25                                
52 10-700 150 29.6002 29.6416 -0.0414     STARD3ex13in13 RNase P 25 2.11 2     2 2 29.6306 30.0076 -0.3770 0.47 -0.08 1.06 1.68 2.67 0.99
53 10-700 162 29.6610 30.3735 -0.7125         25                                
54 10-702 174 28.9266 29.0619 -0.1354     STARD3ex13in13 RNase P 25 2.51 3     2 2 28.2989 28.9259 -0.6270 0.70 -0.33 1.26 1.79 3.54 1.75
55 10-702 186 27.6713 28.7899 -1.1186         25                                
56 10-706 198 24.9504 27.6298 -2.6794     STARD3ex13in13 RNase P 25 10.93 11     2 2 24.5920 27.3389 -2.7469 0.10 -2.45 5.47 10.43 11.45 1.02
57 10-706 210 24.2335 27.0480 -2.8144         25                                
58 10-707 222 28.2856 31.5813 -3.2958     STARD3ex13in13 RNase P 25 17.86 18     2 2 28.0050 31.4606 -3.4556 0.23 -3.16 8.93 15.99 19.96 3.97
59 10-707 234 27.7245 31.3399 -3.6155         25                                
60 10-709 246 25.8650 26.9244 -1.0594     STARD3ex13in13 RNase P 25 3.07 3     2 2 25.3540 26.2703 -0.9162 0.20 -0.62 1.54 2.78 3.39 0.61
61 10-709 258 24.8431 25.6161 -0.7731         25                                
62 10-710 270 25.9666 30.0601 -4.0935     STARD3ex13in13 RNase P 25 29.21 29     2 2 26.2508 30.4159 -4.1651 0.10 -3.87 14.61 27.80 30.70 2.90
63 10-710 282 26.5350 30.7717 -4.2367         25                                
64 10-713 294 29.1828 30.3198 -1.1370     STARD3ex13in13 RNase P 25 3.60 4     2 2 29.0304 30.1752 -1.1447 0.01 -0.85 1.80 3.58 3.62 0.04
65 10-713 306 28.8781 30.0306 -1.1525         25                                
66 10-715 318 26.1538 26.6611 -0.5073     STARD3ex13in13 RNase P 25 2.55 3     2 2 25.7282 26.3757 -0.6476 0.20 -0.35 1.28 2.31 2.81 0.50
67 10-715 330 25.3026 26.0904 -0.7878         25                                
68 DNActrl 366 24.1695 24.5478 -0.3783     STARD3ex13in13 RNase P 25 2.00 2     2 2 24.0631 24.3598 -0.2967 0.12 0.00 1.00 1.89 2.12 0.23
69 DNActrl 378 23.9568 24.1718 -0.2150         25                                
70 NTC 342 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex13in13 RNase P 25         2                    
71 NTC 354 undetermined undetermined undetermined x NTC     25