Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl30_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex13in13                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl30_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 3:22:37 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 6                                                    
28 - 3 Copies: 3                                                    
29 - 4 Copies: 2                                                    
30 - 5 Copies: 1                                                    
31 > 10 Copies: 3                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36                                                      
37 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
38 10-835 6 28.3053 29.8775 -1.5722     STARD3ex13in13 RNase P 30 4.97 5     2 2 28.2990 29.9317 -1.6327 0.09 -1.31 2.49 4.77 5.19 0.42
39 10-835 18 28.2927 29.9859 -1.6932         30                                
40 10-838 30 23.0763 27.2283 -4.1521     STARD3ex13in13 RNase P 30 31.37 31     2 2 22.7537 27.0435 -4.2898 0.19 -3.97 15.69 28.51 34.51 6.00
41 10-838 42 22.4311 26.8587 -4.4276         30                                
42 10-839a 54 26.3452 26.6529 -0.3077     STARD3ex13in13 RNase P 30 1.81 2     2 2 26.5552 26.7285 -0.1733 0.19 0.15 0.90 1.65 1.99 0.34
43 10-839a 66 26.7651 26.8041 -0.0390         30                                
44 10-840 78 25.8616 26.5141 -0.6524     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.42 2     2 2 25.9681 26.5639 -0.5958 0.08 -0.28 1.21 2.33 2.52 0.19
45 10-840 90 26.0746 26.6136 -0.5391         30                                
46 10-841a 102 27.7142 29.3925 -1.6784     STARD3ex13in13 RNase P 30 4.18 4     2 2 28.0221 29.4033 -1.3812 0.42 -1.06 2.09 3.40 5.13 1.73
47 10-841a 114 28.3300 29.4141 -1.0841         30                                
48 10-851 126 26.3617 27.1999 -0.8382     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.62 3     2 2 26.6062 27.3166 -0.7104 0.18 -0.39 1.31 2.40 2.87 0.47
49 10-851 138 26.8507 27.4333 -0.5825         30                                
50 10-852 150 25.1508 29.2174 -4.0666     STARD3ex13in13 RNase P 30 29.52 30     2 2 25.0071 29.2091 -4.2020 0.19 -3.88 14.76 26.87 32.42 5.55
51 10-852 162 24.8635 29.2009 -4.3374         30                                
52 10-853 174 26.4113 26.9777 -0.5664     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.15 2     2 2 26.6976 27.1181 -0.4205 0.21 -0.10 1.07 1.94 2.37 0.43
53 10-853 186 26.9840 27.2586 -0.2746         30                                
54 10-855 198 26.6115 27.0715 -0.4600     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.02 2     2 2 26.9366 27.2675 -0.3309 0.18 -0.01 1.01 1.84 2.21 0.36
55 10-855 210 27.2617 27.4636 -0.2019         30                                
56 10-856 222 28.3219 29.6261 -1.3042     STARD3ex13in13 RNase P 30 3.60 4     2 2 28.3273 29.4958 -1.1685 0.19 -0.85 1.80 3.28 3.96 0.68
57 10-856 234 28.3328 29.3655 -1.0328         30                                
58 10-857 246 27.6804 28.4356 -0.7552     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.64 3     2 2 27.6685 28.3889 -0.7205 0.05 -0.40 1.32 2.58 2.71 0.13
59 10-857 258 27.6566 28.3423 -0.6858         30                                
60 10-861 270 26.2777 26.7375 -0.4598     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.67 3     2 2 25.9378 26.6709 -0.7331 0.39 -0.41 1.33 2.21 3.22 1.02
61 10-861 282 25.5978 26.6042 -1.0064         30                                
62 10-865 294 28.3087 28.3901 -0.0813     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.11 2     2 2 28.1749 28.5695 -0.3946 0.44 -0.08 1.05 1.70 2.62 0.92
63 10-865 306 28.0411 28.7490 -0.7079         30                                
64 10-867 318 22.8730 26.1449 -3.2719     STARD3ex13in13 RNase P 30 15.44 15     2 2 22.7726 26.0394 -3.2668 0.01 -2.95 7.72 15.38 15.49 0.11
65 10-867 330 22.6722 25.9338 -3.2617         30                                
66 DNActrl 366 23.6443 23.8884 -0.2441     STARD3ex13in13 RNase P 30 2.00 2     2 2 23.3569 23.6754 -0.3185 0.11 0.00 1.00 1.90 2.11 0.21
67 DNActrl 378 23.0695 23.4624 -0.3929         30                                
68 NTC 342 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex13in13 RNase P 30         2                    
69 NTC 354 undetermined undetermined undetermined x NTC     30