Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120903_1000_2ndset_pl5_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex13in13                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120903_1000_2ndset_pl5_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/3/12 3:04:06 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 2 Copies: 8                                                    
26 - 3 Copies: 2                                                    
27 - 4 Copies: 2                                                    
28 - 7 Copies: 1                                                    
29 - 8 Copies: 1                                                    
30 > 10 Copies: 1                                                    
31                                                      
32 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
33 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
34 - Negative control sample well: 2                                                    
35                                                      
36 Delta Ct variance: 0.1419                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-102 6 29.2383 29.6635 -0.4252     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.63 3 < 0.50 0.18 2 2 28.6277 29.1125 -0.4849 0.08 -0.39 1.31 2.52 2.74 0.22
41 10-102 18 28.0170 28.5615 -0.5445         5                                
42 10-103 30 29.5427 29.8610 -0.3184     STARD3ex13in13 RNase P 5 1.91 2 0.90 0.07 2 2 29.4635 29.4873 -0.0239 0.42 0.07 0.95 1.56 2.34 0.78
43 10-103 42 29.3843 29.1136 0.2706         5                                
44 10-105 54 27.1687 28.1446 -0.9760     STARD3ex13in13 RNase P 5 3.08 3 < 0.50 0.02 2 2 27.4413 28.1565 -0.7152 0.37 -0.62 1.54 2.57 3.69 1.12
45 10-105 66 27.7140 28.1684 -0.4544         5                                
46 10-106 78 29.2405 31.3011 -2.0606     STARD3ex13in13 RNase P 5 6.62 7 < 0.50 0.15 2 2 28.6411 30.4599 -1.8189 0.34 -1.73 3.31 5.60 7.83 2.23
47 10-106 90 28.0416 29.6187 -1.5771         5                                
48 10-107 102 25.1790 25.4325 -0.2535     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.17 2 0.85 0.08 2 2 25.4876 25.6992 -0.2116 0.06 -0.12 1.09 2.11 2.24 0.13
49 10-107 114 25.7961 25.9658 -0.1697         5                                
50 10-109 126 26.4093 26.6429 -0.2336     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.03 2 0.89 0.05 2 2 25.9885 26.1015 -0.1130 0.17 -0.02 1.02 1.87 2.21 0.34
51 10-109 138 25.5677 25.5602 0.0075         5                                
52 10-110 150 25.0970 28.1866 -3.0897     STARD3ex13in13 RNase P 5 16.00 16 < 0.50 0.14 2 2 25.0805 28.1715 -3.0910 0.00 -3.00 8.00 15.98 16.02 0.03
53 10-110 162 25.0641 28.1564 -3.0924         5                                
54 10-112 174 26.3527 27.6220 -1.2693     STARD3ex13in13 RNase P 5 3.77 4 < 0.50 0.12 2 2 26.3152 27.3210 -1.0058 0.37 -0.91 1.89 3.14 4.53 1.38
55 10-112 186 26.2776 27.0200 -0.7423         5                                
56 10-113 198 27.5190 27.8539 -0.3349     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.34 2 0.59 0.31 2 2 27.8626 28.1816 -0.3190 0.02 -0.23 1.17 2.32 2.37 0.05
57 10-113 210 28.2062 28.5093 -0.3031         5                                
58 10-114 222 27.9958 27.7917 0.2041     STARD3ex13in13 RNase P 5 1.59 2 0.98 0.57 2 2 27.6779 27.4348 0.2431 0.06 0.33 0.79 1.54 1.63 0.09
59 10-114 234 27.3600 27.0780 0.2820         5                                
60 10-115 246 32.5459 32.7228 -0.1770     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.12 2 0.61 0.11 2 1 32.5459 32.7228 -0.1770 0.00 -0.09 1.06 2.12 2.12 0.00
61 10-115 258 32.7078 33.7684 -1.0606 x VICET     5                                
62 10-117 270 27.1883 28.3230 -1.1347     STARD3ex13in13 RNase P 5 3.86 4 < 0.50 0.09 2 2 27.2330 28.2721 -1.0391 0.14 -0.95 1.93 3.61 4.12 0.51
63 10-117 282 27.2778 28.2213 -0.9435         5                                
64 10-119 294 28.2294 28.1253 0.1041     STARD3ex13in13 RNase P 5 1.77 2 0.95 0.14 2 2 28.0950 28.0076 0.0874 0.02 0.18 0.88 1.75 1.79 0.04
65 10-119 306 27.9606 27.8899 0.0706         5                                
66 10-120 318 25.9134 28.0415 -2.1281     STARD3ex13in13 RNase P 5 7.57 8 < 0.50 0.10 2 2 25.4501 27.4618 -2.0117 0.16 -1.92 3.79 6.99 8.21 1.22
67 10-120 330 24.9869 26.8822 -1.8953         5                                
68 DNActrl 366 25.0407 25.0481 -0.0074     STARD3ex13in13 RNase P 5 2.00 2 0.88 0.05 2 2 24.8225 24.9135 -0.0910 0.12 0.00 1.00 1.89 2.12 0.23
69 DNActrl 378 24.6042 24.7789 -0.1746         5                                
70 NTC 342 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex13in13 RNase P 5         2                    
71 NTC 354 undetermined undetermined undetermined x NTC     5