Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin13/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120904_1000_2ndset_pl9_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex13in13                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120904_1000_2ndset_pl9_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/4/12 4:00:46 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 4                                                    
28 - 1 Copy: 5                                                    
29 - 2 Copies: 2                                                    
30 - 3 Copies: 1                                                    
31 - 4 Copies: 1                                                    
32 - 6 Copies: 2                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 10                                                    
35 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
36 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 7                                                    
37 - Negative control sample well: 2                                                    
38                                                      
39                                                      
40 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
41 10-211 6 26.5956 26.1041 0.4915     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.33 1     2 2 26.5978 26.1590 0.4388 0.07 0.59 0.67 1.28 1.38 0.10
42 10-211 18 26.5999 26.2138 0.3861         9                                
43 10-215 30 29.3769 28.8644 0.5124     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.42 1     2 2 28.8212 28.4787 0.3426 0.24 0.49 0.71 1.27 1.60 0.34
44 10-215 42 28.2656 28.0929 0.1727         9                                
45 10-216 54 29.5629 29.4429 0.1200     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.30 1     2 2 29.9800 29.5086 0.4714 0.50 0.62 0.65 1.02 1.66 0.64
46 10-216 66 30.3971 29.5744 0.8227         9                                
47 10-221a 78 29.0704 28.2583 0.8121     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.28 1     2 2 28.1455 27.6477 0.4979 0.44 0.65 0.64 1.03 1.59 0.56
48 10-221a 90 27.2207 27.0370 0.1836         9                                
49 10-222 102 25.1372 26.8797 -1.7425     STARD3ex13in13 RNase P 9 5.78 6     2 2 25.2444 26.9227 -1.6783 0.09 -1.53 2.89 5.53 6.04 0.51
50 10-222 114 25.3515 26.9656 -1.6142         9                                
51 10-223c 126 25.7556 25.7763 -0.0207     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.89 2     2 2 25.2417 25.3098 -0.0682 0.07 0.08 0.95 1.83 1.96 0.12
52 10-223c 138 24.7278 24.8434 -0.1156         9                                
53 10-226 150 30.0770 30.0986 -0.0216     STARD3ex13in13 RNase P 9 1.47 1     2 2 30.5455 30.2457 0.2998 0.45 0.45 0.73 1.17 1.83 0.66
54 10-226 162 31.0140 30.3927 0.6213         9                                
55 10-228 174 33.0719 34.0962 -1.0243 x VICET STARD3ex13in13 RNase P 9         2                    
56 10-228 186 32.4195 33.2726 -0.8530 x VICET     9                                
57 10-230T 198 29.1325 30.1467 -1.0141     STARD3ex13in13 RNase P 9 4.11 4     2 2 28.7274 29.9143 -1.1869 0.24 -1.04 2.06 3.65 4.63 0.99
58 10-230T 210 28.3222 29.6819 -1.3597         9                                
59 10-233 222 undetermined undetermined undetermined x NOVIC STARD3ex13in13 RNase P 9         2                    
60 10-233 234 undetermined 36.1949 undetermined x VICET     9                                
61 10-234 246 35.4230 35.7332 -0.3102 x VICET STARD3ex13in13 RNase P 9         2                    
62 10-234 258 34.6830 36.1815 -1.4985 x VICET     9                                
63 10-235 270 33.5844 35.0220 -1.4377 x VICET STARD3ex13in13 RNase P 9         2                    
64 10-235 282 32.7941 35.7332 -2.9391 x VICET     9                                
65 10-237b 294 26.0513 27.6865 -1.6352     STARD3ex13in13 RNase P 9 5.73 6     2 2 25.9701 27.6374 -1.6673 0.05 -1.52 2.87 5.61 5.86 0.26
66 10-237b 306 25.8890 27.5883 -1.6994         9                                
67 10-238 318 26.4797 27.0976 -0.6178     STARD3ex13in13 RNase P 9 3.14 3     2 2 25.9648 26.7623 -0.7975 0.25 -0.65 1.57 2.77 3.55 0.78
68 10-238 330 25.4499 26.4271 -0.9772         9                                
69 DNActrl 366 24.1942 24.2049 -0.0107     STARD3ex13in13 RNase P 9 2.00 2     2 2 23.9710 24.1187 -0.1477 0.19 0.00 1.00 1.82 2.20 0.38
70 DNActrl 378 23.7478 24.0324 -0.2847         9                                
71 NTC 342 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex13in13 RNase P 9         2                    
72 NTC 354 undetermined undetermined undetermined x NTC     9