Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120905_1000_2ndset_pl12_01_2.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex2in2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120905_1000_2ndset_pl12_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/5/12 3:50:35 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 3                                                    
28 - 3 Copies: 3                                                    
29 - 4 Copies: 2                                                    
30 - 5 Copies: 3                                                    
31 - 6 Copies: 2                                                    
32 - 7 Copies: 1                                                    
33 - 9 Copies: 1                                                    
34                                                      
35 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-283 5 27.7040 29.4329 -1.7289     STARD3ex2in2 RNase P 12 6.04 6     2 2 26.5294 28.7809 -2.2515 0.74 -1.60 3.02 4.21 8.68 4.48
41 10-283 17 25.3548 28.1289 -2.7741         12                                
42 10-284 29 26.0295 27.2335 -1.2040     STARD3ex2in2 RNase P 12 5.05 5     2 2 25.5234 27.5161 -1.9927 1.12 -1.34 2.53 2.92 8.73 5.80
43 10-284 41 25.0173 27.7986 -2.7813         12                                
44 10-285 53 27.2033 28.4608 -1.2575     STARD3ex2in2 RNase P 12 2.20 2     2 2 27.7577 28.5525 -0.7948 0.65 -0.14 1.10 1.60 3.03 1.44
45 10-285 65 28.3121 28.6443 -0.3322         12                                
46 10-286 77 27.6509 30.2325 -2.5816     STARD3ex2in2 RNase P 12 6.91 7     2 2 27.5440 29.9884 -2.4444 0.19 -1.79 3.45 6.28 7.60 1.32
47 10-286 89 27.4372 29.7444 -2.3072         12                                
48 10-287 101 25.6429 28.1603 -2.5175     STARD3ex2in2 RNase P 12 4.98 5     2 2 26.0690 28.0405 -1.9715 0.77 -1.32 2.49 3.41 7.27 3.86
49 10-287 113 26.4951 27.9206 -1.4255         12                                
50 10-288 125 24.7528 25.3732 -0.6203     STARD3ex2in2 RNase P 12 2.25 2     2 2 24.6615 25.4860 -0.8245 0.29 -0.17 1.12 1.95 2.59 0.64
51 10-288 137 24.5702 25.5989 -1.0287         12                                
52 10-290 149 26.0859 27.7926 -1.7067     STARD3ex2in2 RNase P 12 4.65 5     2 2 26.0874 27.9619 -1.8746 0.24 -1.22 2.33 4.14 5.23 1.09
53 10-290 161 26.0889 28.1313 -2.0424         12                                
54 10-292 173 26.5791 28.4627 -1.8836     STARD3ex2in2 RNase P 12 6.27 6     2 2 25.6844 27.9879 -2.3035 0.59 -1.65 3.13 4.68 8.38 3.70
55 10-292 185 24.7898 27.5132 -2.7234         12                                
56 10-293 197 25.5006 27.4581 -1.9575     STARD3ex2in2 RNase P 12 3.52 4     2 2 26.1314 27.6034 -1.4720 0.69 -0.82 1.76 2.52 4.93 2.42
57 10-293 209 26.7622 27.7487 -0.9865         12                                
58 10-294 221 25.8989 26.8917 -0.9928     STARD3ex2in2 RNase P 12 2.88 3     2 2 25.6675 26.8490 -1.1815 0.27 -0.53 1.44 2.53 3.28 0.76
59 10-294 233 25.4360 26.8062 -1.3702         12                                
60 10-296 245 25.9690 28.3262 -2.3572     STARD3ex2in2 RNase P 12 4.39 4     2 2 26.7577 28.5465 -1.7888 0.80 -1.13 2.19 2.96 6.50 3.55
61 10-296 257 27.5465 28.7669 -1.2204         12                                
62 10-297 281 27.1228 28.2693 -1.1465     STARD3ex2in2 RNase P 12 2.81 3     1 1 27.1228 28.2693 -1.1465 0.00 -0.49 1.41 2.81 2.81 0.00
63 10-298 293 29.1796 31.8741 -2.6944     STARD3ex2in2 RNase P 12 8.54 9     2 2 28.5425 31.2922 -2.7497 0.08 -2.09 4.27 8.22 8.87 0.65
64 10-298 305 27.9053 30.7103 -2.8050         12                                
65 10-299 317 26.4599 27.7766 -1.3167     STARD3ex2in2 RNase P 12 3.06 3     2 2 26.6950 27.9667 -1.2717 0.06 -0.62 1.53 2.97 3.16 0.19
66 10-299 329 26.9302 28.1569 -1.2267         12                                
67 DNActrl 365 24.1089 24.5043 -0.3954     STARD3ex2in2 RNase P 12 2.00 2     2 2 23.6137 24.2696 -0.6558 0.37 0.00 1.00 1.67 2.40 0.73
68 DNActrl 377 23.1185 24.0348 -0.9163         12                                
69 NTC 341 37.8457 undetermined undetermined x NTC STARD3ex2in2 RNase P 12         2                    
70 NTC 353 undetermined undetermined undetermined x NTC     12