Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120906_1000_2ndset_pl14-01_2.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex2in2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120906_1000_2ndset_pl14-01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/6/12 1:46:43 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 - 4 Copies: 1                                                    
29 - 5 Copies: 2                                                    
30 - 6 Copies: 2                                                    
31 - 7 Copies: 2                                                    
32 - 8 Copies: 1                                                    
33 - 9 Copies: 1                                                    
34 - 10 Copies: 1                                                    
35 > 10 Copies: 4                                                    
36                                                      
37 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
38 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
39 - Negative control sample well: 1                                                    
40                                                      
41                                                      
42 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
43 10-327 5 28.6549 31.2853 -2.6305     STARD3ex2in2 RNase P 14 8.64 9     2 2 28.6247 30.8832 -2.2585 0.53 -2.11 4.32 6.68 11.18 4.50
44 10-327 17 28.5946 30.4812 -1.8866         14                                
45 10-329 29 26.0128 27.1853 -1.1725     STARD3ex2in2 RNase P 14 5.32 5     2 2 25.8557 27.4155 -1.5598 0.55 -1.41 2.66 4.07 6.96 2.89
46 10-329 41 25.6986 27.6456 -1.9471         14                                
47 10-330 53 25.9209 28.3553 -2.4343     STARD3ex2in2 RNase P 14 6.53 7     2 2 26.1943 28.0489 -1.8545 0.82 -1.71 3.27 4.37 9.76 5.39
48 10-330 65 26.4677 27.7425 -1.2748         14                                
49 10-331 77 25.7656 27.7035 -1.9378     STARD3ex2in2 RNase P 14 5.86 6     2 2 26.0901 27.7895 -1.6994 0.34 -1.55 2.93 4.97 6.92 1.95
50 10-331 89 26.4146 27.8756 -1.4610         14                                
51 10-333 101 23.2524 27.5800 -4.3276     STARD3ex2in2 RNase P 14 34.18 34     2 2 23.3346 27.5772 -4.2426 0.12 -4.10 17.09 32.23 36.26 4.03
52 10-333 113 23.4167 27.5745 -4.1577         14                                
53 10-335 125 26.3984 28.2800 -1.8815     STARD3ex2in2 RNase P 14 7.64 8     2 2 26.0406 28.1217 -2.0811 0.28 -1.93 3.82 6.65 8.77 2.12
54 10-335 137 25.6828 27.9635 -2.2807         14                                
55 10-336 149 25.3747 27.7810 -2.4063     STARD3ex2in2 RNase P 14 7.12 7     2 2 25.7900 27.7684 -1.9784 0.61 -1.83 3.56 5.29 9.57 4.28
56 10-336 161 26.2054 27.7558 -1.5505         14                                
57 10-337 173 25.8670 28.3931 -2.5261     STARD3ex2in2 RNase P 14 11.39 11     2 2 25.6269 28.2839 -2.6571 0.19 -2.51 5.69 10.40 12.47 2.07
58 10-337 185 25.3868 28.1747 -2.7880         14                                
59 10-338 197 26.1559 27.3755 -1.2196     STARD3ex2in2 RNase P 14 3.57 4     2 2 26.3187 27.3034 -0.9846 0.33 -0.84 1.79 3.04 4.21 1.17
60 10-338 209 26.4816 27.2312 -0.7496         14                                
61 10-339 221 22.7688 28.7873 -6.0186     STARD3ex2in2 RNase P 14 83.34 83     2 2 23.0190 28.5473 -5.5283 0.69 -5.38 41.67 59.33 117.07 57.74
62 10-339 233 23.2691 28.3072 -5.0380         14                                
63 10-340 245 26.9135 29.6138 -2.7003     STARD3ex2in2 RNase P 14 10.06 10     2 2 27.0234 29.5014 -2.4780 0.31 -2.33 5.03 8.62 11.74 3.11
64 10-340 257 27.1333 29.3891 -2.2558         14                                
65 10-341 269 31.1258 32.8186 -1.6928     STARD3ex2in2 RNase P 14 5.84 6     2 1 31.1258 32.8186 -1.6928 0.00 -1.55 2.92 5.84 5.84 0.00
66 10-341 281 32.1497 33.7026 -1.5529 x VICET     14                                
67 10-342 293 26.2041 27.5371 -1.3329     STARD3ex2in2 RNase P 14 5.11 5     2 2 25.8374 27.3385 -1.5011 0.24 -1.35 2.56 4.55 5.74 1.19
68 10-342 305 25.4706 27.1399 -1.6692         14                                
69 10-343 317 24.3101 30.1878 -5.8777     STARD3ex2in2 RNase P 14 95.06 95     2 2 24.5982 30.3164 -5.7181 0.23 -5.57 47.53 85.11 106.17 21.07
70 10-343 329 24.8863 30.4449 -5.5586         14                                
71 DNActrl 365 24.6316 24.7790 -0.1474     STARD3ex2in2 RNase P 14 2.00 2     1 1 24.6316 24.7790 -0.1474 0.00 0.00 1.00 2.00 2.00 0.00
72 NTC 353 32.6357 undetermined undetermined x NTC STARD3ex2in2 RNase P 14         1