Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120907_1000_2ndset_pl16_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex2in2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120907_1000_2ndset_pl16_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/7/12 10:39:18 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 1                                                    
29 - 3 Copies: 2                                                    
30 - 4 Copies: 2                                                    
31 - 5 Copies: 3                                                    
32 - 6 Copies: 2                                                    
33 - 7 Copies: 1                                                    
34 > 10 Copies: 3                                                    
35                                                      
36 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
37 - Undetermined VIC Ct: 1                                                    
38 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
39 - Negative control sample well: 2                                                    
40                                                      
41                                                      
42 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
43 10-376 5 27.3326 31.6981 -4.3655     STARD3ex2in2 RNase P 16 31.11 31     2 2 26.4934 30.4774 -3.9840 0.54 -3.96 15.55 23.88 40.52 16.64
44 10-376 17 25.6542 29.2566 -3.6025         16                                
45 10-377 29 28.5910 29.3113 -0.7203     STARD3ex2in2 RNase P 16 3.24 3     2 2 29.0100 29.7324 -0.7224 0.00 -0.70 1.62 3.24 3.25 0.01
46 10-377 41 29.4291 30.1536 -0.7245         16                                
47 10-378 53 29.8189 30.8267 -1.0078     STARD3ex2in2 RNase P 16 3.80 4     2 2 29.7694 30.7206 -0.9511 0.08 -0.93 1.90 3.65 3.95 0.30
48 10-378 65 29.7200 30.6144 -0.8944         16                                
49 10-382 77 26.1936 28.0201 -1.8265     STARD3ex2in2 RNase P 16 6.03 6     2 2 26.2022 27.8199 -1.6177 0.30 -1.59 3.02 5.22 6.97 1.75
50 10-382 89 26.2108 27.6196 -1.4088         16                                
51 10-385 101 26.2155 27.2528 -1.0373     STARD3ex2in2 RNase P 16 3.93 4     2 2 26.0547 27.0540 -0.9993 0.05 -0.97 1.97 3.83 4.03 0.21
52 10-385 113 25.8938 26.8552 -0.9613         16                                
53 10-386T 125 26.6965 27.9340 -1.2374     STARD3ex2in2 RNase P 16 5.10 5     2 2 26.4257 27.7998 -1.3741 0.19 -1.35 2.55 4.64 5.60 0.97
54 10-386T 137 26.1550 27.6657 -1.5107         16                                
55 10-390 149 24.4080 25.9231 -1.5151     STARD3ex2in2 RNase P 16 5.85 6     2 2 24.3076 25.8820 -1.5743 0.08 -1.55 2.93 5.62 6.10 0.48
56 10-390 161 24.2073 25.8408 -1.6335         16                                
57 10-391 173 25.4593 27.4243 -1.9651     STARD3ex2in2 RNase P 16 7.19 7     2 2 25.3975 27.2683 -1.8707 0.13 -1.85 3.59 6.73 7.68 0.94
58 10-391 185 25.3358 27.1122 -1.7764         16                                
59 10-393 197 24.4078 27.7227 -3.3150     STARD3ex2in2 RNase P 16 18.49 18     2 2 24.6675 27.9006 -3.2331 0.12 -3.21 9.24 17.47 19.57 2.10
60 10-393 209 24.9272 28.0785 -3.1513         16                                
61 10-396 221 26.9780 27.4670 -0.4890     STARD3ex2in2 RNase P 16 2.66 3     2 2 27.1455 27.5835 -0.4380 0.07 -0.41 1.33 2.57 2.76 0.19
62 10-396 233 27.3130 27.7000 -0.3871         16                                
63 10-398 245 undetermined 36.3657 undetermined x VICET STARD3ex2in2 RNase P 16         2                    
64 10-398 257 undetermined undetermined undetermined x NOVIC     16                                
65 10-402b 269 25.9373 27.2964 -1.3591     STARD3ex2in2 RNase P 16 4.97 5     2 2 25.9936 27.3323 -1.3387 0.03 -1.31 2.49 4.90 5.04 0.14
66 10-402b 281 26.0499 27.3682 -1.3183         16                                
67 10-404 293 25.5373 28.8873 -3.3500     STARD3ex2in2 RNase P 16 18.70 19     2 2 25.4620 28.7116 -3.2497 0.14 -3.22 9.35 17.44 20.05 2.60
68 10-404 305 25.3867 28.5360 -3.1493         16                                
69 10-406 317 25.5762 26.9408 -1.3646     STARD3ex2in2 RNase P 16 4.97 5     2 2 25.6283 26.9677 -1.3394 0.04 -1.31 2.49 4.89 5.06 0.17
70 10-406 329 25.6803 26.9946 -1.3142         16                                
71 DNActrl 365 24.5875 24.5649 0.0226     STARD3ex2in2 RNase P 16 2.00 2     2 2 24.5939 24.6187 -0.0247 0.07 0.00 1.00 1.94 2.07 0.13
72 DNActrl 377 24.6004 24.6725 -0.0721         16                                
73 NTC 341 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex2in2 RNase P 16         2                    
74 NTC 353 undetermined undetermined undetermined x NTC     16