Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STARD3_exin2/.excel/excel_reader2.php on line 916
  A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z AA
1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120913_1000_2ndset_pl28_01.txt                                                    
5 Target name: STARD3ex2in2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120913_1000_2ndset_pl28_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/13/12 11:28:32 AM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 2 Copies: 1                                                    
28 - 3 Copies: 4                                                    
29 - 4 Copies: 3                                                    
30 - 5 Copies: 2                                                    
31 - 8 Copies: 1                                                    
32 > 10 Copies: 4                                                    
33                                                      
34 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
35 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
36 - Negative control sample well: 2                                                    
37                                                      
38                                                      
39 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
40 10-784 5 27.9889 29.6621 -1.6732     STARD3ex2in2 RNase P 28 5.30 5     2 2 27.8334 29.1519 -1.3185 0.50 -1.41 2.65 4.15 6.78 2.63
41 10-784 17 27.6779 28.6417 -0.9638         28                                
42 10-785 29 29.6560 30.4609 -0.8049     STARD3ex2in2 RNase P 28 2.97 3     2 2 30.0640 30.5485 -0.4844 0.45 -0.57 1.49 2.38 3.71 1.33
43 10-785 41 30.4721 30.6360 -0.1639         28                                
44 10-786 53 28.7095 29.4181 -0.7087     STARD3ex2in2 RNase P 28 4.25 4     2 2 28.6142 29.6143 -1.0001 0.41 -1.09 2.13 3.47 5.20 1.73
45 10-786 65 28.5189 29.8105 -1.2915         28                                
46 10-789 77 30.8000 32.7801 -1.9801     STARD3ex2in2 RNase P 28 8.39 8     2 1 30.8000 32.7801 -1.9801 0.00 -2.07 4.19 8.39 8.39 0.00
47 10-789 89 30.5803 33.4421 -2.8618 x VICET     28                                
48 10-791 101 28.6740 29.9586 -1.2846     STARD3ex2in2 RNase P 28 5.34 5     2 2 28.5802 29.9084 -1.3283 0.06 -1.42 2.67 5.18 5.50 0.32
49 10-791 113 28.4863 29.8582 -1.3719         28                                
50 10-792 125 27.4029 28.4331 -1.0303     STARD3ex2in2 RNase P 28 4.48 4     2 2 27.4671 28.5424 -1.0753 0.06 -1.16 2.24 4.34 4.62 0.28
51 10-792 137 27.5313 28.6516 -1.1203         28                                
52 10-793 149 27.2156 29.5354 -2.3197     STARD3ex2in2 RNase P 28 10.70 11     2 2 27.3126 29.6450 -2.3324 0.02 -2.42 5.35 10.61 10.80 0.19
53 10-793 161 27.4095 29.7545 -2.3450         28                                
54 10-795a 173 27.7679 28.6106 -0.8427     STARD3ex2in2 RNase P 28 3.47 3     2 2 27.8055 28.5139 -0.7084 0.19 -0.80 1.74 3.16 3.81 0.65
55 10-795a 185 27.8431 28.4173 -0.5742         28                                
56 10-797 197 29.3593 29.8011 -0.4418     STARD3ex2in2 RNase P 28 3.01 3     2 2 29.8339 30.3337 -0.4998 0.08 -0.59 1.50 2.89 3.13 0.24
57 10-797 209 30.3084 30.8663 -0.5579         28                                
58 10-800 221 25.5153 28.3092 -2.7938     STARD3ex2in2 RNase P 28 15.19 15     2 2 25.4490 28.2866 -2.8376 0.06 -2.93 7.60 14.74 15.66 0.92
59 10-800 233 25.3827 28.2641 -2.8814         28                                
60 10-803 245 30.0224 30.9557 -0.9333     STARD3ex2in2 RNase P 28 3.28 3     2 2 30.2291 30.8564 -0.6273 0.43 -0.71 1.64 2.66 4.06 1.40
61 10-803 257 30.4358 30.7570 -0.3212         28                                
62 10-805 269 27.3169 29.6689 -2.3520     STARD3ex2in2 RNase P 28 10.97 11     2 2 27.1449 29.5122 -2.3674 0.02 -2.46 5.48 10.85 11.08 0.23
63 10-805 281 26.9729 29.3556 -2.3828         28                                
64 10-807 293 23.6809 29.6226 -5.9416     STARD3ex2in2 RNase P 28 126.53 127     2 2 23.9125 29.8081 -5.8956 0.07 -5.98 63.26 122.56 130.63 8.07
65 10-807 305 24.1441 29.9937 -5.8496         28                                
66 10-808 317 29.4513 30.8096 -1.3584     STARD3ex2in2 RNase P 28 3.84 4     2 2 29.9657 30.8182 -0.8525 0.72 -0.94 1.92 2.70 5.45 2.75
67 10-808 329 30.4801 30.8268 -0.3467         28                                
68 DNActrl 365 23.9713 23.9218 0.0496     STARD3ex2in2 RNase P 28 2.00 2     2 2 23.9722 23.8845 0.0877 0.05 0.00 1.00 1.95 2.05 0.11
69 DNActrl 377 23.9731 23.8472 0.1259         28                                
70 NTC 341 undetermined undetermined undetermined x NTC STARD3ex2in2 RNase P 28         2                    
71 NTC 353 undetermined undetermined undetermined x NTC     28