Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/STAT3in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/STAT3in2ex2/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120914_1000_3rdsetonly_pl16_last.txt                                                    
5 Target name: STAT3in2ex2                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120914_1000_3rdsetonly_pl16_last                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/14/12 2:56:43 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 12                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - 1 Copy: 3                                                    
28 - 2 Copies: 5                                                    
29 - 3 Copies: 3                                                    
30                                                      
31 Total number of wells omitted from analysis: 3                                                    
32 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 1                                                    
33 - Negative control sample well: 2                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-877 29 30.5746 30.4635 0.1111     STAT3in2ex2 RNase P 16 1.30 1     2 2 31.1404 30.5784 0.5620 0.64 0.62 0.65 0.95 1.78 0.83
38 10-877 35 31.7061 30.6932 1.0129         16                                
39 10-881 53 27.0501 27.6103 -0.5602     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.94 3     2 2 26.9095 27.5264 -0.6169 0.08 -0.56 1.47 2.83 3.06 0.23
40 10-881 59 26.7689 27.4425 -0.6736         16                                
41 10-882 77 31.9678 32.2271 -0.2593     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.30 2     2 1 31.9678 32.2271 -0.2593 0.00 -0.20 1.15 2.30 2.30 0.00
42 10-882 83 32.0926 33.2974 -1.2048 x VICET     16                                
43 10-883 101 31.6934 32.4135 -0.7201     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.89 3     2 2 31.8392 32.4291 -0.5899 0.18 -0.53 1.44 2.64 3.16 0.52
44 10-883 107 31.9850 32.4447 -0.4597         16                                
45 10-884 125 31.6501 31.4328 0.2174     STAT3in2ex2 RNase P 16 1.36 1     2 2 32.0875 31.5879 0.4996 0.40 0.56 0.68 1.12 1.65 0.53
46 10-884 131 32.5250 31.7430 0.7819         16                                
47 10-885 149 28.2640 28.9885 -0.7245     STAT3in2ex2 RNase P 16 3.46 3     2 2 28.5684 29.4193 -0.8510 0.18 -0.79 1.73 3.17 3.78 0.61
48 10-885 155 28.8728 29.8502 -0.9775         16                                
49 10-887 221 29.4304 29.6763 -0.2460     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.24 2     2 2 29.4194 29.6424 -0.2231 0.03 -0.16 1.12 2.21 2.28 0.07
50 10-887 227 29.4084 29.6086 -0.2002         16                                
51 10-888 245 28.5325 28.2714 0.2611     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.01 2     2 2 28.6439 28.7121 -0.0683 0.47 -0.01 1.01 1.60 2.53 0.93
52 10-888 251 28.7552 29.1528 -0.3976         16                                
53 10-891 269 28.7221 28.4749 0.2472     STAT3in2ex2 RNase P 16 1.89 2     2 2 28.5192 28.4941 0.0251 0.31 0.08 0.94 1.62 2.20 0.58
54 10-891 275 28.3163 28.5132 -0.1970         16                                
55 341 293 31.6411 31.0088 0.6324     STAT3in2ex2 RNase P 16 1.23 1     2 2 31.8929 31.2535 0.6395 0.01 0.70 0.62 1.23 1.24 0.01
56 341 299 32.1447 31.4981 0.6466         16                                
57 DNActrl 341 23.9899 23.9294 0.0605     STAT3in2ex2 RNase P 16 2.00 2     2 2 23.8848 23.9439 -0.0591 0.17 0.00 1.00 1.84 2.17 0.33
58 DNActrl 347 23.7797 23.9584 -0.1787         16                                
59 NTC 317 undetermined undetermined undetermined x NTC STAT3in2ex2 RNase P 16         2                    
60 NTC 323 undetermined undetermined undetermined x NTC     16