Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/TP53exin8/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/TP53exin8/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120912_1000_2ndset_pl27_01.txt                                                    
5 Target name: TP53 in8ex8                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120912_1000_2ndset_pl27_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/12/12 4:02:30 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22 Warning:                                                    
23 Insufficient data points to estimate confidence and z-score values.
                                                   
24                                                      
25 Total number of samples: 16                                                    
26 - Negative control: 1                                                    
27 - Undetermined: 1                                                    
28 - 2 Copies: 6                                                    
29 - 3 Copies: 5                                                    
30 - 4 Copies: 2                                                    
31 - 6 Copies: 1                                                    
32                                                      
33 Total number of wells omitted from analysis: 4                                                    
34 - VIC Ct exceeded the specified detection threshold (33.0): 2                                                    
35 - Negative control sample well: 2                                                    
36                                                      
37                                                      
38 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
39 10-749 2 30.6856 31.2144 -0.5288     TP53 in8ex8 RNase P 27 3.43 3     2 2 30.3389 30.9870 -0.6481 0.17 -0.78 1.71 3.15 3.72 0.57
40 10-749 14 29.9922 30.7596 -0.7674         27                                
41 10-750 26 29.9380 29.9183 0.0197     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.77 3     2 2 29.7494 30.0934 -0.3440 0.51 -0.47 1.39 2.16 3.57 1.41
42 10-750 38 29.5608 30.2685 -0.7077         27                                
43 10-754 50 32.7695 32.7584 0.0111     TP53 in8ex8 RNase P 27 1.59 2     2 2 33.2149 32.7587 0.4561 0.63 0.33 0.80 1.17 2.17 1.00
44 10-754 62 33.6602 32.7591 0.9011         27                                
45 10-756 74 27.5935 28.3053 -0.7118     TP53 in8ex8 RNase P 27 3.65 4     2 2 27.6783 28.4196 -0.7413 0.04 -0.87 1.83 3.58 3.73 0.15
46 10-756 86 27.7631 28.5339 -0.7708         27                                
47 10-760 98 29.6188 30.2386 -0.6198     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.77 3     2 2 30.2830 30.6235 -0.3406 0.39 -0.47 1.38 2.28 3.36 1.08
48 10-760 110 30.9471 31.0084 -0.0613         27                                
49 10-765 122 31.2129 31.2716 -0.0587     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.25 2     2 2 31.1889 31.2323 -0.0434 0.02 -0.17 1.13 2.23 2.28 0.05
50 10-765 134 31.1649 31.1930 -0.0281         27                                
51 10-766 146 30.7541 30.9423 -0.1882     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.41 2     2 2 31.2546 31.3967 -0.1421 0.07 -0.27 1.21 2.34 2.49 0.15
52 10-766 158 31.7550 31.8511 -0.0961         27                                
53 10-768 170 31.6547 31.4727 0.1820     TP53 in8ex8 RNase P 27 1.90 2     2 2 31.9104 31.7118 0.1986 0.02 0.07 0.95 1.88 1.93 0.04
54 10-768 182 32.1661 31.9509 0.2152         27                                
55 10-769 194 31.5638 32.1776 -0.6138     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.61 3     2 2 31.6844 31.9413 -0.2569 0.50 -0.39 1.31 2.04 3.35 1.31
56 10-769 206 31.8051 31.7050 0.1000         27                                
57 10-771 218 32.0071 34.0357 -2.0286 x VICET TP53 in8ex8 RNase P 27         2                    
58 10-771 230 34.9225 35.9212 -0.9987 x VICET     27                                
59 10-773 242 26.5883 28.0141 -1.4258     TP53 in8ex8 RNase P 27 5.81 6     2 2 26.8744 28.2844 -1.4100 0.02 -1.54 2.90 5.75 5.87 0.13
60 10-773 254 27.1606 28.5548 -1.3942         27                                
61 10-775 266 28.3740 28.9893 -0.6153     TP53 in8ex8 RNase P 27 3.44 3     2 2 28.6766 29.3286 -0.6520 0.05 -0.78 1.72 3.35 3.52 0.17
62 10-775 278 28.9792 29.6679 -0.6887         27                                
63 10-779 290 28.8454 28.8440 0.0014     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.41 2     2 2 28.8254 28.9658 -0.1405 0.20 -0.27 1.20 2.18 2.66 0.47
64 10-779 302 28.8054 29.0877 -0.2823         27                                
65 10-781 314 27.5579 28.5474 -0.9896     TP53 in8ex8 RNase P 27 4.27 4     2 2 27.6560 28.6217 -0.9657 0.03 -1.09 2.13 4.20 4.34 0.14
66 10-781 326 27.7541 28.6959 -0.9418         27                                
67 DNActrl 362 23.4329 23.2805 0.1524     TP53 in8ex8 RNase P 27 2.00 2     2 2 23.5765 23.4481 0.1284 0.03 0.00 1.00 1.97 2.03 0.07
68 DNActrl 374 23.7201 23.6157 0.1044         27                                
69 NTC 338 undetermined undetermined undetermined x NTC TP53 in8ex8 RNase P 27         2                    
70 NTC 350 undetermined undetermined undetermined x NTC     27