Warning: require_once(): It is not safe to rely on the system's timezone settings. You are *required* to use the date.timezone setting or the date_default_timezone_set() function. In case you used any of those methods and you are still getting this warning, you most likely misspelled the timezone identifier. We selected the timezone 'UTC' for now, but please set date.timezone to select your timezone. in /home/gkatak/public_html/17CN/TP53exin8/.excel/excel_reader2.php on line 916

Deprecated: Assigning the return value of new by reference is deprecated in /home/gkatak/public_html/17CN/TP53exin8/.excel/excel_reader2.php on line 916
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1 Analysis Software: CopyCaller v2.0                                                    
2                                                      
3                                                      
4 File name: 20120914_1000_2ndset_pl31_01.txt                                                    
5 Target name: TP53 in8ex8                                                    
6 Reference name: RNase P                                                    
7                                                      
8 File Header:                                                    
9 SDS 2.2.1 AQ Results 1.0                                                    
10 Filename 20120914_1000_2ndset_pl31_01                                                    
11 PlateID                                                    
12 Assay Type Absolute Quantification                                                    
13 Run DateTime 9/14/12 12:09:53 PM                                                    
14 Operator                                                    
15 ThermalCycleParams                                                    
16                                                      
17 Analysis Parameters:                                                    
18 VIC Ct detection threshold: 33.0                                                    
19 Calibrator sample: DNActrl                                                    
20 Calibrator sample copy number: 2                                                    
21                                                      
22                                                      
23 Total number of samples: 16                                                    
24 - Negative control: 1                                                    
25 - 2 Copies: 7                                                    
26 - 3 Copies: 6                                                    
27 - 4 Copies: 1                                                    
28 - 5 Copies: 1                                                    
29                                                      
30 Total number of wells omitted from analysis: 2                                                    
31 - Negative control sample well: 2                                                    
32                                                      
33 Delta Ct variance: 0.1452                                                    
34                                                      
35                                                      
36 Sample Name Well Position FAM Ct VIC Ct Delta Ct Omitted Flag Replicate Comments Target Reference Plate ID CN Calculated CN Predicted Confidence |Z-Score| Replicate Count Replicates Analyzed FAM Ct Mean VIC Ct Mean Delta Ct Mean Delta Ct SD Delta Delta Ct RQ Min CN Max CN CN Range Sample Comments
37 10-868 2 28.6163 29.1501 -0.5338     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.75 3 < 0.50 0.24 2 2 28.6587 29.1757 -0.5169 0.02 -0.46 1.37 2.72 2.78 0.06
38 10-868 14 28.7012 29.2013 -0.5001         31                                
39 10-870 26 25.7800 25.9862 -0.2062     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.34 2 < 0.50 0.30 2 2 25.5842 25.8704 -0.2861 0.11 -0.23 1.17 2.22 2.47 0.26
40 10-870 38 25.3885 25.7545 -0.3661         31                                
41 10-871 50 26.3429 26.7218 -0.3788     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.59 3 < 0.50 0.79 2 2 26.5409 26.9707 -0.4298 0.07 -0.37 1.29 2.50 2.68 0.18
42 10-871 62 26.7388 27.2196 -0.4808         31                                
43 10-872 74 26.2417 26.4609 -0.2192     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.20 2 0.77 0.06 2 2 26.0191 26.2164 -0.1973 0.03 -0.14 1.10 2.17 2.24 0.07
44 10-872 86 25.7966 25.9719 -0.1753         31                                
45 10-873 98 26.2383 27.5138 -1.2756     TP53 in8ex8 RNase P 31 4.75 5 < 0.50 0.11 2 2 26.4724 27.7790 -1.3067 0.04 -1.25 2.37 4.65 4.85 0.20
46 10-873 110 26.7065 28.0442 -1.3378         31                                
47 10-875 122 25.9074 26.2735 -0.3661     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.18 2 0.63 0.07 2 2 26.0335 26.2195 -0.1860 0.25 -0.13 1.09 1.93 2.47 0.55
48 10-875 134 26.1595 26.1655 -0.0060         31                                
49 10-877 146 29.3582 29.2904 0.0678     TP53 in8ex8 RNase P 31 1.68 2 0.98 1.20 2 2 29.9855 29.7888 0.1967 0.18 0.26 0.84 1.53 1.83 0.30
50 10-877 158 30.6128 30.2872 0.3256         31                                
51 10-881 170 26.3156 26.8998 -0.5842     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.87 3 0.58 0.10 2 2 26.3730 26.9508 -0.5777 0.01 -0.52 1.43 2.85 2.88 0.03
52 10-881 182 26.4304 27.0017 -0.5713         31                                
53 10-882 194 32.1516 32.9978 -0.8463     TP53 in8ex8 RNase P 31 3.13 3 0.80 0.04 2 2 31.7259 32.4292 -0.7034 0.20 -0.64 1.56 2.83 3.45 0.62
54 10-882 206 31.3001 31.8606 -0.5605         31                                
55 10-883 218 30.9306 31.9408 -1.0102     TP53 in8ex8 RNase P 31 3.70 4 < 0.50 0.22 2 2 31.1802 32.1246 -0.9444 0.09 -0.89 1.85 3.53 3.87 0.34
56 10-883 230 31.4297 32.3084 -0.8787         31                                
57 10-884 242 30.8897 31.4231 -0.5333     TP53 in8ex8 RNase P 31 3.00 3 0.77 0.07 2 2 30.5499 31.1944 -0.6446 0.16 -0.59 1.50 2.78 3.24 0.46
58 10-884 254 30.2100 30.9658 -0.7558         31                                
59 10-885 266 28.3924 28.9638 -0.5714     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.90 3 0.66 0.10 2 2 28.3700 28.9646 -0.5947 0.03 -0.54 1.45 2.85 2.95 0.09
60 10-885 278 28.3475 28.9655 -0.6180         31                                
61 10-887 290 29.4553 29.7140 -0.2587     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.22 2 0.52 0.10 2 2 29.4653 29.6774 -0.2120 0.07 -0.15 1.11 2.15 2.30 0.14
62 10-887 302 29.4753 29.6407 -0.1654         31                                
63 10-888 314 27.8568 28.0555 -0.1987     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.28 2 < 0.50 0.21 2 2 28.0312 28.2818 -0.2506 0.07 -0.19 1.14 2.20 2.37 0.16
64 10-888 326 28.2056 28.5080 -0.3025         31                                
65 DNActrl 362 23.8405 23.9566 -0.1161     TP53 in8ex8 RNase P 31 2.00 2 0.92 0.05 2 2 23.7164 23.7751 -0.0587 0.08 0.00 1.00 1.92 2.08 0.16
66 DNActrl 374 23.5922 23.5935 -0.0014         31                                
67 NTC 338 33.8869 undetermined undetermined x NTC TP53 in8ex8 RNase P 31         2                    
68 NTC 350 undetermined undetermined undetermined x NTC     31